Varför behöver ej RNA-polymeraset en primer?
Varför behöver RNA-polymeraset ingen primer, medan DNA-polymeraset gör detta?
Jag tänkte själv att en anledning kunde vara att det är viktigare att det blir rätt vid replikationen än vid transkriptionen, eftersom det då bara bildas fel protein medan det vid replikationen kommer bildas massa felaktiga kopior, men jag vet inte om detta stämmer eller om det är en av anledningarna.
Ja, fel under replikationen måste undvikas till varje pris, precis som du var inne på. Organismen och dess celler tolererar fel i mRNA sekvensen då och då. Det är mycket värre att mutationer sker i genomet, som kan påverka organismen och nästa generation. Skulle produktionen av en proteinmolekyl påverkas är det inte så farligt för organismens fortsatta överlevnad.
Det längre svaret förklaras genom skillnader mellan DNA- och RNA-polymerasen.
DNA-polymerasen har till skillnad från RNA-polymerasen en inbyggd så kallad proof-reading (korrekturläsning på svenska, d.v.s. att det DNA som produceras kontrolleras/rättas). Om det råkar stoppas in en felaktig nukleotidbas så stannar DNA-polymeraset till. Och en exonukleas funktion i polymeraset klyver sedan bort den felaktiga basen och replikationen kan sedan fortsätta igen. Om två nukleotidbaser inte basparar korrekt böjs DNA:t lite, och för att kunna känna av denna böjning behöver DNA-polymeraset hålla i DNA:t lite lösare, så att enzymet stannar till och exonukleasfunktionen aktiveras genom böjningen.
RNA-polymeraset gör inte denna proof-reading, så det håller tag i DNA:t starkare. Även den första nukleotiden hålls i RNA-polymeraset kvar så stadigt att fosfodiesterbindningen till nästa nukleotid kan bildas direkt.
Då DNA-polymeraset gör proof-reading kan det inte hålla fast lika hårt i den första nukleotidbasen, för nukleotidbasen i den platsen måste kunna röra sig lite under DNA-syntesen (annars skulle inte böjningen kunna ske, och då inte rättandet). Men med ett antal nukleotidbaser redan basparande med DNA blir polymerasets grepp stabilt nog för att fosfodiesterbindningen skall kunna ske - därför behövs det en RNA-primer för DNA-polymeraset.
