Vad är CRISPR?
Hej!
Jag har försökt leta upp på nätet men hittar enbart lite krångliga definitioner på vad CRISPR är. Själv har jag förkunskaper om att CRISPR är en teknik som används för att förändra gener och genuttryck, men finns det mer som är värt att nämna?
All hjälp skulle uppskattas! Tack på förhand!
Man hittar en del kommersiella företag som antagligen använder metoden.
Vad säger du om den svenska wikipedia-artikeln?
Jag tycker att de förklarar det lite avancerat och skulle vilja ha en enkel förklaring till detta, eftersom detta är enbart något som jag är intresserad av att veta och ingen speciell uppgift direkt.
Roligt att du vill veta mer!
För det första är det är mer korrekt att referera till hela "maskinen", komplexet, CRISPR-Cas9.
CRISPR är en ss-RNA sträng som ensamt inte gör någonting utan flyter bara omkring. Cas9 är enzymet som använder CRIPSR som "probe" för att hitta och klippa sönder angripande virus DNA/RNA som matchar med den. Även om ingen av delarna kan fungera ensamt tycker jag, om något, att man borde kalla genmanipulationsmetoden för Cas9 eftersom det är den som utför klippandet, men CRISPR låter väl häftigare kanske.
Det här systemet, CRISPR-Cas9, visade sig vara väldigt användbart för oss och inte bara för bakterier hos vilka det upptäcktes. Det är lite mer komplext hur det används för genmanipulation, men det första steget när man vill förändra något i ett genom oavsett metod är såklart att man ska kunna klippa på önskat ställe, och det är det CRISPR-Cas9 kan göra.
Viktigt att förstå är att det långt innan CRISPR-Cas9 fanns metoder för genmanipulation, men CRIPSR-Cas9 gör det med enorm träffsäkerhet och effektivitet jämfört med befintliga metoder. Cas9 är medlem i en större grupp av så kallade endonukleaser (enzymer som kan klippa i DNA). Det finns också exonukleaser. Skillnaden mellan endo och exo är att endonukleaser kan klippa mitt i strängar och exonukleaser tugggar bort nukleotider från ändarna, men båda är en typ av enzymer som kan "klippa" i DNA.
Men vad används CRISPR till, finns det något speciellt som den används till och varför finns den?
Det var ursprungligen en försvarsmekanism för bakterier mot bakteriofager. Vi (Jennifer Doudna och Emmanuelle Charpentier) upptcäkte dock att vi kunde använda till genmodifikation. Är du med?
Första stycken på wikipedia är det här:
CRISPR/Cas9 är ett molekylärt maskineri som finns i vissa bakterier och arkéer, bland andra Streptococcus pyogenes. I naturen är det ett immunförsvar som har till uppgift att förstöra inkräktande DNA-kedjor, till exempel från attackerande virus, genom att klippa sönder inkräktarens DNA. Maskineriet beskrivs därför som en gensax. Maskineriet har modifierats och förenklats så att det kan användas inom bioteknik som en metod för genmodifiering även av andra organismer, exempelvis växter, djur och mänskliga celler. Nobelpriset i kemi 2020[1] går till gensaxens upptäckare, Emmanuelle Charpentier och Jennifer Doudna, för modifieringen av gensaxen.[2]
Jag läste det första stycket men jag undrar enbart av intresse vad det är och hur man kan definiera den.
Så hur skulle ni definiera den förutom att söka på wikipedia?
Varför skulle man inte använda sig av de möjligheter som finns? Varför skulle man uppfinna hjulet en gång till?
Vad menar du?
Varför skulle vi inte använda Wikipedia?
Men vilka fördelar respektive nackdelar finns det med CRISPR?
Jag har ju redan svarat på dina tre av dina fyra frågor i mitt första inlägg:
- Vad används Cripsr till?
- Varför finns den?
- Hur man definierar den
Informationen är framför dig. Du måste lära dig att självständigt extrahera, bearbeta, syntetisera information du läser från källor, var inte lat. Jag gjorde redan en stor del av det arbetet åt dig så att du slipper läsa Wikipedias långa text. Det är en mycket viktig förmåga för resten av gymnasiet och för livet i övrigt.
Okej, det har jag förstått och jag ska gå igenom det snart, men jag har en till fråga, vilka fördelar och nackdelar finns det med CRISPR?
Angående för och nackdelar med CRISPR behöver jag än en gång kommentera formuleringen.
Du menar antagligen: vilka risker/problematik finns det med genmanipulation i människan utifrån etik, sociala frågor och tekniken i sig? Särskilt mot bakgrund av upptäckten av Crispr som för första gången tillåtit oss att göra detta billigt och med precision.
Den etiska och sociala aspekten frågar vi egentligen inte om Crispr specifikt utan om vår (nyinförskaffade) förmåga att manipulera mänskliga gener.
Den tekniska delen angår Crispr i högsta grad, och där kan du titta på följande tabell:
Så kan exempelvis en fördel vara att den är mycket prisvärd? Men hur vet man att den är så prisvärd till skillnad från andra sorters tekniker?
abcdefghijklmo skrev:Okej, det har jag förstått och jag ska gå igenom det snart, men jag har en till fråga, vilka fördelar och nackdelar finns det med CRISPR?
Vad bra, återkom då om det är något mer du inte förstår, men tänk först.
Så kan exempelvis en fördel vara att den är mycket prisvärd? Men hur vet man att den är så prisvärd till skillnad från andra sorters tekniker?
Asså den är inte prisvärd som konsumentvara, det som menas är att den är billig att utföra för en forskare (måste inte vara på mänskliga celler). Jag tänkte säga att du kunde läsa ursprungsartikeln https://www.researchgate.net/publication/309154957_Genome_editing_The_road_of_CRISPRCas9_from_bench_to_clinic
Men jag blir lite misstänksam mot icke västvärldslooking universitet, jag vet inte om King abdullah university of science and technology är internationellt erkänt. Du kan läsa:
https://www.ptglab.com/news/blog/crispr-cas9-talens-and-zfns-the-battle-in-gene-editing/
Tryck Ctrl+F på din dator och sök "affordable".
Och vad menar de med att den är hög genomförbar?
Var står det?
Asså när man kollar från tabellen som du bifogade i #17 så stod det highly feasible vilket är detsamma som hög genomför, vad menar de med det?
Qetsiyah skrev:Roligt att du vill veta mer!
För det första är det är mer korrekt att referera till hela "maskinen", komplexet, CRISPR-Cas9.
CRISPR är en ss-RNA sträng som ensamt inte gör någonting utan flyter bara omkring. Cas9 är enzymet som använder CRIPSR som "probe" för att hitta och klippa sönder angripande virus DNA/RNA som matchar med den. Även om ingen av delarna kan fungera ensamt tycker jag, om något, att man borde kalla genmanipulationsmetoden för Cas9 eftersom det är den som utför klippandet, men CRISPR låter väl häftigare kanske.
Det här systemet, CRISPR-Cas9, visade sig vara väldigt användbart för oss och inte bara för bakterier hos vilka det upptäcktes. Det är lite mer komplext hur det används för genmanipulation, men det första steget när man vill förändra något i ett genom oavsett metod är såklart att man ska kunna klippa på önskat ställe, och det är det CRISPR-Cas9 kan göra.
Viktigt att förstå är att det långt innan CRISPR-Cas9 fanns metoder för genmanipulation, men CRIPSR-Cas9 gör det med enorm träffsäkerhet och effektivitet jämfört med befintliga metoder. Cas9 är medlem i en större grupp av så kallade endonukleaser (enzymer som kan klippa i DNA). Det finns också exonukleaser. Skillnaden mellan endo och exo är att endonukleaser kan klippa mitt i strängar och exonukleaser tugggar bort nukleotider från ändarna, men båda är en typ av enzymer som kan "klippa" i DNA.
Vad menar du med "probe"?
abcdefghijklmo skrev:Asså när man kollar från tabellen som du bifogade i #17 så stod det highly feasible vilket är detsamma som hög genomför, vad menar de med det?
Feasible betyder liksom "gångbar" och betyder på deras respektive rad att det går att göra (dvs multiplexing och "genome wide screen and transformation").
Vad menar du med "probe"?
Det betyder ungefär "detektor". Du kan likna det det vid att gå omkring med en metalldetektor som piper om den känner av metall. Metalldetektorn är crispr och personen som går med den är Cas9. Det crispr letar efter är komplementära DNA eller RNA strängar.
