Trypsin
Hej jag undrar om jag förstått det rätt som att trypIn ENBART klyver peptidbindingar om c- terminal (karbonylgruppen) antingen sitter bundet till lys eller alanin?
innebär det då att det inte spelar någon roll på storleken av peptiden/proteinet och längden?
Nej inte riktigt så. Prova att googla om din fråga på engelska så hittar du nog en bild som illustrerar var/hur klyvningen sker.
Det är f.ö. inte alanin, men lysin stämmer.
Om det blir kämpigt med söktermer, får du experimentera lite, du kan t.ex. testa något liknande:
"trypsin recognition sequence" och sedan välja bilder.
oki tack så mycket för kvar. när man säger karbonylkolet i en polypeptid menar man alfa kolet?
Maddefoppa skrev:oki tack så mycket för kvar. när man säger karbonylkolet i en polypeptid menar man alfa kolet?
Nej, ta en titt på en aminosyra i t.ex. biokemiboken, så ser du tydligare de olika funktionella grupperna. Och en av dessa är karbonyl-/karboxylgruppen.
Benämningen "alfa-" följer samma regler som för fettsyror. I fallet med aminosyran, binds de funktionella grupperna till varandra av det centrala "alfa-kolet".
Aha så alfa kolet är samma som karbonylkolet?
Nej. Leta rätt på en bild i biokemiboken eller på nätet, med alfakolet utritat så ser du.
Trör jag förstått det som att karbonyl kolet binder allt C=O pch till C-C(alfa) , C-N se bild som jag ritat. Har jag förståt det rätt som att dubbelbindningen delvis varierar pga O elektronegatovtet i förhållande till N
Ja det är där karbonylkolet är.
Ser du nu skillnaden mellan detta kol och alfa-kolet?
R-gruppen sitter även bunden direkt till alfa-kolet (även om det inte är utritat i bilden).
Ja men precis. Och den är väl också detta karbonyl kolet som dubbelbindindings resonansen uppkommer?
