Transkription-TATAboxen?
Hej!
Jag har det lite svårt att förstå mig på vad tataboxen är för något och andra saker som hänger ihop med det. Det jag förstår är att det finns promotorer som är "startpunkt" där RNA-polymeraset påbörjar transkriptionen och att de finns antingen 10 eller 35 uppströms. Dock förstår jag inte vad:
1. tataboxen är, är det -10 och -35 regionen eller är det bara -10 regionen?
2. Vad är skillnaden mellan tataboxen och pribnow box
3. Är -10 regionen en stark promotor och -35 en svag promotor?
4. Förstår inte skillnaden mellan eukaryota och prokaryota celler när det gäller allt detta.
Ställer många frågor men har verkligen svårt för att förstå mig på detta, tack för hjälpen i förväg:)
1. TATA-boxens placering skiljer sig mellan rikena, och även inom fram för allt eukayrota. Överlag så finns den hos: eukaryoter (-35 till -25), archaea (ca -25 bp). Prokayroternas motsvarighet är Pribnow boxen (ca -10).
2. Pribnow boxen återfinns bara i prokayroa och är mycket kortare, endast 6 baspar. Ytterligare en sekvens anses tillhöra Pribnow-boxen (lite längre och sekvens mer uppströms ca -35).
3. Nej. En promotors styrka eller promotorns aktivitet, d.v.s. hur mycket den får genen att transkriberas, beror inte på TATA-boxen. Till promotorn (som är mycket större än TATA-boxen) binder proteiner, t.ex. transkriptionsfaktorer som modulerar genens transkription. Flera olika faktorer binder till flera olika delar av promotorn och ökar eller minskar sannolikheten att transkription av just denna gen sker. TATA-boxen ingår dock i promotorregionen, men den finns i vid varje gen, så TATA-boxen kan inte påverka hur mycket de enskilda generna transkriberas.
4. Titta på svaren 1-3 och kanske vidare på Wiki. Om du har fler frågor återkom.
