Rita aminosyrasekvensen.
Hej! En uppgift i kemiboken handlar om att rita aminosyrasekvensen CRVYIHTF. Dessutom ska man markera peptidbindningar och C- samt N-terminalen.
Jag vet att peptidbindningar är mellan karboxylsyrans kolatom i ena aminosyran, och amingruppens kväveatom i andra. OH gruppen i ena reagerar med H i andra och bildar vatten. Molekylerna går ihop och vattnet avspjälkas (kondensationsreaktion).
Jag har däremot svårt att veta hur aminosyrorna i sekvensen ska kopplas ihop, speciellt när en aminosyra har sin R grupp till vänster/höger och inte "neråt", eftersom jag själv måste vrida på molekylen i min ritning. Blir förvirrad. Hade någon kunnat hjälpa till?
Tack på förhand!
Facits lösning:
Du får virda hur du vill på aminosyrorna. Ett tips är att ha amin till vänster, karboxylsyra till höger i sidokedjan rakt ned. I din sekvens blir den första, C (cystein) längst till vänster med en fri amin. Sen kommer de andra aminosyrorna R tom T. Sist blir F (fenylalanin) med en fri karboxyl. Bindningarna mellan aminosyrorna blir peptidbindningar. Kristallklart?
Nästan! Vad menas med "fri"? I facit står samma sak, fri amingrupp och fri karboxylgrupp. De är ju inkulderade i sekvensen?