Reaktionsmekanism när en fosfolipid bildas
Hej, jag undrar om jag har gjort en korrekt reaktionsmekanism på en slags esterbildning när fosfolipider bildas.
(R = resten av en lipid)
Samtidigt funderar jag över reaktionsmekanismen där en kvävebas slås ihop med exempelvis ribos:
Kommer kvävet i adenosinmolekylen att göra en nukleofil-attack på kol 1 i ribosen?
Tack,
oscardrottinger skrev:Hej, jag undrar om jag har gjort en korrekt reaktionsmekanism på en slags esterbildning när fosfolipider bildas.
(R = resten av en lipid)
Mekanismen för bildningen av fosfoestern stämmer.
Samtidigt funderar jag över reaktionsmekanismen där en kvävebas slås ihop med exempelvis ribos:
Kommer kvävet i adenosinmolekylen att göra en nukleofil-attack på kol 1 i ribosen?
Tack,
Och mekanismen för N-glykosidbindningen stämmer nästan. Den ena reaktanten inte är ribos utan en fosforlyerad form av ribos, fosforibosyl pyrofosfat som har en difosfat på kol1 och en monofosfat på kol 5 (som i bilden nedan):
Difosfatatgruppen på kol 1 (till höger i bilden) behövs för underlätta att bindningen till syreatomen på kol1 skall brytas. Och denna bindning behöver brytas i samband med att bindningen mellan aminogruppen och kol1 bildas. De två fosfaterna gör tillsammans med syreatomen en bra lämnande grupp, en pyrofosfat. Denna utmärkta lämnande grupp gör att reaktionen kan ske lätt (det frigörs massvis med energi i samband med att den energirika fosfoesterbindningen bryts).
Att just kolhydrater aktiveras genom att bindas till fosfatgrupper (eller t.o.m. nukleotider) är vanligt bland de enzymer som katalyserar denna form av reaktioner i cellerna, de s.k. glykosyltransferaserna.
Intressant, tack så mycket för ett bra svar!