Proteins struktur - veckning
Har jag förstått rätt?
+ Ett par frågor:
1 struktur = aminosyrasekvensen
2 struktur = primära strukturen viker sig till olika formationer, alfa helix och beta sheet. Däremellan finns sträckor med oordnade aminosekvenser som inte har någon bestämd struktur - men som ändå kan bilda vissa bindningar mellan varandra pga att sidokedjorna är polära/laddade/hydrofoba.
(Fråga 1: är alfa helix och beta sheets de ända 2-strukturerna eller finns det andra som också kallas 2-struktur?)
3 struktur = nu viks hela kedjan till ett protein. Här kan olika områden i kedjan vikas till vad som kallas domäner - vilka kan vara av nyare unik typ och av en typ hittad i många proteiner, vilka av evolutionen "tagits fram" och visat sig vara "användbara" och som upprepas i många proteiner. En domän ges av en speciell aminosyrasekvens i 1-strukturen och genom genomsekvensering kan man hitta vilka genom som har vissa domäner genom att där se om de finns i genomet.
4 struktur = 3-strukturer kan mha vätebindningar, jonbindningar, hydrofoba interaktioner, disulfidbryggor och vdW-attraktioner kombineras till en 4-struktur, vilken består av 2+ "subunits".
Det ser rätt ut. Jag kollade wikipedia snabbt och det finns andra sekundärstrukturer men man ser dem ytterst sällan i verkliga proteiner.
https://en.wikipedia.org/wiki/Protein_secondary_structure#Types
Ah, tack - ber om ursäkt. Kollade igenom google lite men missade faktiskt det - läste nog för dåligt...