Protein
"Vilka bindningar i proteinet nedan bryts då pH ökar till 13. Förklara också varför bindningarna skulle brytas
"
Borde inte de sura sidokedjorna avge protoner för att neutralisera? Då borde D den elektrostatiska attraktionen brytas då lysins NH3+ kommer avge en proton till överskottet av hydroxid joner?
Detta stämmer inte, facit säger att de basiska sidogrupperna, de med högt pI kommer avge protoner? Baser kan väll ändå inte avge protoner?
Sen undrar jag också varför OH-gruppen i A inte kommer avge en proton?
Hur ska man tolka frågan? Samtidigt står det att pH ökar till 13, det skulle väll kunna tolkas som att basiska sidokedjor kommer uppta protoner från vattnet?
Facit: Höjt pH gör att de basiska sidogrupperna, de med högt IP, avger en proton till OH- och blir oladdade. I D kommer lysins NH3+ att avge en proton och bli oladdad. Den elektrostatiska bindningen bryts.
Stämmer facit?
Superkemisten skrev:"Vilka bindningar i proteinet nedan bryts då pH ökar till 13. Förklara också varför bindningarna skulle brytas
Borde inte de sura sidokedjorna avge protoner för att neutralisera? Då borde D den elektrostatiska attraktionen brytas då lysins NH3+ kommer avge en proton till överskottet av hydroxid joner?
Detta stämmer inte, facit säger att de basiska sidogrupperna, de med högt pI kommer avge protoner? Baser kan väll ändå inte avge protoner?
Sen undrar jag också varför OH-gruppen i A inte kommer avge en proton?
Hur ska man tolka frågan? Samtidigt står det att pH ökar till 13, det skulle väll kunna tolkas som att basiska sidokedjor kommer uppta protoner från vattnet?
Facit: Höjt pH gör att de basiska sidogrupperna, de med högt IP, avger en proton till OH- och blir oladdade. I D kommer lysins NH3+ att avge en proton och bli oladdad. Den elektrostatiska bindningen bryts.Stämmer facit?
Ja, facit stämmer.
Tänk dig en ammoniumjon, NH4+. Om man har en vattenlösning som innehåller ammoniumjoner och tillsätter hydroxidjoner, så kommer hydroxidjonerna att reagera med ammoniumjonen, som ju är en syra och alltså kan avge en vätejon, så att det bildas ammoniak och vatten.
Proteinet fungerar likadant. De protonerade basiska sidokedjorna är syror.
Sen undrar jag också varför OH-gruppen i A inte kommer avge en proton?
Varför skulle den? Alkoholer är inte syror.
Jag fattar inte vad du menar med
De protonerade basiska sidokedjorna är syror.
Är NH3, Lysin en syra då eller bas?
Det är väll en bas som blivit protolyserad och då är det väll ändå en syra?
Om kvävet i sidokedjan binder till tre väteatomer så är den en syra, d v s den kan avge en vätejon. Om kvävet i sidokedjan binder till två stycken väteatomer, så är den en bas, d v s den kan ta upp ytterligare en vätejon.
Okej, men i det här fallet är det alltså en syra eftersom det är NH3+ och den avger en proton till OH-.
I boken står det att Lysin är en basisk aminosyra, trots att den är positivt laddad och kväve binder till tre väteatomer och en kolatom. Den vill ju då avge en proton och är då en syra. Det är detta som gör mig väldigt förvirrad.
Därav tror jag även facit säger att det är basiska sidogrupper. Men det är ju en Syra?
Eller är det för att man anger den i sitt pI tillstånd?
Aminosyrorna brukar beskrivas efter deras egenskaper vid fysiologiskt pH (7,4), där vissa agerar som baser (tar upp en proton) och andra som syror (avger en proton). Ändras pH dramatiskt uppåt kommer baserna till slut att avge sin proton. Och motsvarande om pH sänks dramatiskt kommer syrorna att ta upp en proton. Kan ett ämne verka som en syra, kan det även verka som en bas.
En bas kan finnas i sitt "bastillstånd" (-NH3) och då ta upp en proton. Men i och med att basen tar upp en proton övergår den till sitt "syratillstånd" (-NH4+), och kan då bete sig som en syra, d.v.s. avge en proton.
Precis liknande det för syror, där syran (-COOH) kan protolyseras och bilda sin korresponderande bas (-COO-), och denna kan agera som bas, d.v.s. ta upp en proton.
