Phenyalanine icke polär vätebindingar
Phenalanine är en icke polär aminosyra pga av att den inte har en aromisk ring och det kan inte bilda vätebindningar? varför det förstår jag inte den har ju O och Oh grupper som fungerar perfekt som punkter för vätebindningar. 
När aminosyrornas delas upp efter sina egenskaper, vilken del av molekylen avgör hur aminosyran klassificeras?
mag1 skrev:När aminosyrornas delas upp efter sina egenskaper, vilken del av molekylen avgör hur aminosyran klassificeras?
R-gruppen, men trotts detta borde väl ändå reseten av aminosyran kunna bilda vätebinginar?
Ja, den fria aminosyrans amino- och karboxylsyragrupp kan bilda vätebindningar. Men inom biokemin betraktas oftast aminosyrorna som del av proteiner/polypeptider. Och i dessa är båda ändarna del i peptidbindningar.
Men delar du upp peptidbindningen, så består den av en karbonylgrupp (C=O) och en sekundär amin (R1-NH-R2) - och båda dessa kan precis som du misstänkte delta i vätebindningar. Och detta är precis vad som sker i proteiner, där t.ex. alfahelixar hålls ihop av precis dessa typer av vätebindningar, där karbonylgruppens syreatom och aminogruppen bildar vätebindningar. Och motsvarande sker i beta-strängar/flak.
Utan dessa vätebindningar skulle inte sekundärstrukturer kunna uppstå.
Jaha, så en aminosyra som kan bilda vätebindningar är alltså en aminosyra som har N, O, F på sin R-Grupp. Man betraktar alltså ”vätebindnings” förmåga efter sidogrupp
RisPris skrev:Jaha, så en aminosyra som kan bilda vätebindningar är alltså en aminosyra som har N, O, F på sin R-Grupp. Man betraktar alltså ”vätebindnings” förmåga efter sidogrupp
Det med. Men de delar som är gemensamma för alla aminosyror i proteiner (amin- och karbonylgruppen) kan även de vätebinda - och det är dessa vätebindningar som håller ihop alfahelixar och betasträngar.
