2 svar
75 visningar
eddberlu 1816
Postad: 10 maj 2024 20:59

Peptider

Hur var det man döper aminosyror som kondenserar? Tog man den som behåller karboxylsyran sist i namnet?

Jepp! Det blir långa, krångliga namn ;)

mag1 9768
Postad: 28 jan 22:47

Ja, i den bildade polypeptiden har karboxylsyragruppen högst prioritet vid namngivningen. Ofta anges sekvensen av aminosyror istället för IUPAC-namnet, just för det blir väl invecklade namn (speciellt med samtliga stereokemiska center angivna)

 

Även en ganska korta polypeptid, t.ex. peptidhormonet angiotensin II (som binder till angiotensin II receptorn, vilket även Sars-CoV2 viruset binder till) kan beskrivas kort som:

L-alpha-aspartyl-L-arginyl-L-valyl-L-tyrosyl-L-isoleucyl-L-histidyl-L-prolyl-L-phenylalanine

Ännu kortare som Asp-Arg-Val-Tyr-Ile-His-Pro-Phe, eller DRVYIHPF

 

alternativt med alla sterocenter angivna:

(3S)-3-amino-4-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S,3S)-1-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(1S)-1-carboxy-2-phenylethyl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3-(1H-imidazol-5-yl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-4-oxobutanoic acid

 

Polypeptiden behöver inte bli lång innan även kemister slutar använda det fullständiga IUPAC-namnet.

Svara
Close