Peptider
Hur var det man döper aminosyror som kondenserar? Tog man den som behåller karboxylsyran sist i namnet?
Jepp! Det blir långa, krångliga namn ;)
Ja, i den bildade polypeptiden har karboxylsyragruppen högst prioritet vid namngivningen. Ofta anges sekvensen av aminosyror istället för IUPAC-namnet, just för det blir väl invecklade namn (speciellt med samtliga stereokemiska center angivna)
Även en ganska korta polypeptid, t.ex. peptidhormonet angiotensin II (som binder till angiotensin II receptorn, vilket även Sars-CoV2 viruset binder till) kan beskrivas kort som:
L-alpha-aspartyl-L-arginyl-L-valyl-L-tyrosyl-L-isoleucyl-L-histidyl-L-prolyl-L-phenylalanine
Ännu kortare som Asp-Arg-Val-Tyr-Ile-His-Pro-Phe, eller DRVYIHPF
alternativt med alla sterocenter angivna:
(3S)-3-amino-4-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S,3S)-1-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(1S)-1-carboxy-2-phenylethyl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3-(1H-imidazol-5-yl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-4-oxobutanoic acid
Polypeptiden behöver inte bli lång innan även kemister slutar använda det fullständiga IUPAC-namnet.