Nomenklatur
Jag förstår inte nomenklaturen av fettsyror, varifrån börjar man räkna och vart slutar man? Hittar olika på youtube och vet inte vad jag ska utgå från.
Hittar dock inte så mycket om det med omega och alfakol, hur nomenklaturen hör dit?
Av det jag förstått så börjar man räkna alfa kolet (som ligger närmast karbonylföreningen) som kol 1 och omega kolet markerar sista kolet? Men jag fattar inte hur detta hör samman och hur man ska tänka vid sådana fall/namngivning?
Du har fattat det rätt. Alfakolet är det kolet som är direkt bundet till karbonylkolet i karboxylsyragruppen, och det sista kolet i kolkedjan är omegakolet.
I en del sammanhang är det praktiskt att utgå ifrån alfakolet när något skall beskrivas, t.ex. under metabilismen där fettsyror bryts ner genom beta-oxidationen. Där får du direkt från namnet veta var oxidationen sker. Och för denna reaktion spelar det ingen roll om kolkedjan är t.ex. 4 eller 20 kol lång - reaktionen sker ändå endast på det nästföljande kolet till alfakolet - d.v.s. beta-kolet.
I andra sammanhang, t.ex. för mättnadsgraden hos fettsyror och speciellt de essentiella, är det mer intressant att räkna ifrån slutet av kedjan. Och det är av rent biokemiska orsaker, eftersom bl.a. vi människor inte kan introducera dubbelbindningar i slutet av fettsyran (omega-3, omega-6). Vi saknar helt enkelt enzym för att göra detta, till skillnad från bl.a. växter och vissa mikroorganismer. Det är därför omega-3/6 fettsyrorna är essentiella, vi behöver dessa men kan inte bilda dem själva. Vissa fettsyror är dessutom långa, 20 kol eller fler, och då är det bekvämt att kunna ange en position i kolkedjan med ett så lågt nummer som möjligt. Jämför om du ritar ut strukturen av en fettsyra med 20 kol, och t.ex. vill beskriva ett kol, då är det smidigare att kalla det beta-6 istället för alfa-14.
När fettsyrorna syntetiseras i våra celler, sker det från acetyl-CoA enheter, så den bildade fettsyran blir mättad. Och vi behöver massvis med omättade fettsyror, så det finns enzymer som kan introducera dubbelbindningar i fettsyror. Men, dessa enzym kan inte introducera dubbelbindningarna i slutet av kolkedjan (vid omega-änden), utan gör det mer nära alfa-sidan av kolkedjan.
Tack snälla!
Men det här med omega, hur kommer det sig att linolensyra heter 18:3, omega-3? Har man fått fram det genom att den första dubbelbindningen sitter alltså på 3 plats räknat från baklänges?
Det är heller inte lika tydligt vid nomenklatur för organiska fettsyror då de inte utgår från dessa grekiska "metan,etan,propan m.m" utan mer i form av "palmatinsyra, oljesyre, stearinsyra, eikosapentaensyra", hur ska man veta vad dessa heter samt deras dubbelbindningar (antal och vart de sitter?)
Tillägg: 4 okt 2023 19:33
Varför säger man att omega kolet är det sista kolet,
men sedan visar det ju också vid bakvänd räkning där första dubbelbindningen sitter?
naturnatur1 skrev:Tack snälla!
Men det här med omega, hur kommer det sig att linolensyra heter 18:3, omega-3? Har man fått fram det genom att den första dubbelbindningen sitter alltså på 3 plats räknat från baklänges?
Ja, det är räknat från motsatta änden av karboxylgruppen.
Alfa- respektive beta- anger varifrån man utgår ifrån när man räknar. Precis som du kan räkna tågets vagnar från loket (alfa-kolet), så kan du räkna ifrån den sista vagnen (beta-). Vad som är fram eller bak beror på din utgångspunkt.
Det är heller inte lika tydligt vid nomenklatur för organiska fettsyror då de inte utgår från dessa grekiska "metan,etan,propan m.m" utan mer i form av "palmatinsyra, oljesyre, stearinsyra, eikosapentaensyra", hur ska man veta vad dessa heter samt deras dubbelbindningar (antal och vart de sitter?)
Fettsyrorna anges ofta med traditionella/generiska namn, som palmitinsyran du nämnde, vilken det finns mycket av i palmoljeträdets frön - det finns m.a.o. en historisk orsak till namnet. Det finns många ämnen som har dessa namn, myrsyra och ättiksyra t.ex.
Dessa ämnen har sina standardiserade kemiska namn också, metan- och etansyra, men det finns oftast ingen direkt koppling mellan namnen, det blir bara till att lära sig bägge.
Tillägg: 4 okt 2023 19:33
Varför säger man att omega kolet är det sista kolet,
men sedan visar det ju också vid bakvänd räkning där första dubbelbindningen sitter?
Inte säker på vad du menar, men jag misstänker att jag redan svarat på denna fråga överst i detta inlägg.