Multi-enzyme systems
Hej kan hjälpa och förstå hur man räknar ut bilden längst ner. Vet inte hur jag ska räkna. Kan någon förklara hur man frågan så det blir enklare?
Ett multienzymsystem kan definieras som ett antal olika enzymer som katalyserar på varandra följande reaktioner där en produkt av en enzymatisk reaktion är ett substrat för nedströmsreaktionen. Ett av de mest studerade multi-enzymsystemen i cellen är glykolys. Den består av tio olika enzymer som finns i cellcytoplasman. I reaktionen av glykolys oxideras en enda glukosmolekyl till pyruvat, vilket ger två ATP och två NADH. I detta laboratorium kommer vi att studera tre olika reaktioner som är kopplade till varandra i glykolysen.
HK
Glucose + MgATP ↔ Glucose-6-Phosphate + MgADP-
GAPDH
GAP + Pi + NAD+ ↔ 1,3-Bisphosphoglyceric acid + NADH + H+
PGK
1,3-Bisphosphoglyceric acid + MgADP- ↔ 3-Phosphoglycerate + MgATP
Med tanke på reaktionskomponenterna och förstå mekanismen för tre glykolysreaktioner, försök att förutsäga resultatet av experimentet nedan. Kommentera effekten av olika tillsatser, utarbeta varför de utlöste en viss reaktion eller inte.
Börja med att titta på vad som finns i ditt provrör, vad händer när detta blandas ihop? Kan någon reaktion ske?
Titta sedan på varje tillsats (finns det mer än ett additive?), vad som kommer att ske i ditt provrör när det tillsätts?
Är det inte bara en additive?
Jag har inte aning, det är en uppgift från ditt kompendium!
Men eftersom det står en etta längst till höger, kan man misstänka att det kunde vara fler. Sedan står det även:
Kommentera effekten av olika tillsatser, utarbeta varför de utlöste en viss reaktion eller inte.
Vad sägs om att börja med den angivna tillsatsen "1" och lista ut vad du tror händer.
de finns 4 olika substrate men jag ska bara göra en vilket är denna
Okej.
Börja med att titta på vad som finns i ditt provrör, vad händer när detta blandas ihop? Kan någon reaktion ske?
Vad tror du händer när GAPDH tillsätts?
Tillägget av GAPDH utlöser reaktionen. Se substratrollen i de nedan nämnda reaktionspilarna
Glömde skriva i frågan till det i frågan "Studera komponenterna, förutsäga vad som händer med absorbansvärdena för NADH och kommentera varför?"
Kommer NADH att öka eller minska.
Kan någon ge mig en bättre bild på hur jag ska fatta det här?
Du har kopierat några steg ur glykolysen, men det är inte svaret på frågan:
1) När du tillsätter GAPDH till din reaktionsblandning vad bildas och vad förbrukas?
Ställ upp en reaktionsformel för just de steg som sker, och titta på vad som förbrukas och vad som bildas (så blir nog resten mer greppbart).
2) Om absorbansen ökar eller minskar beror på vid vilken våglängd mäter du absorbansen och vad som bildas genom reaktionen, utan denna information kan vi inte hjälpa dig besvara din fråga.
3) Vet du varför du mäter absorbansen vid detta experiment?
mag1 skrev:Du har kopierat några steg ur glykolysen, men det är inte svaret på frågan:
1) När du tillsätter GAPDH till din reaktionsblandning vad bildas och vad förbrukas?
Ställ upp en reaktionsformel för just de steg som sker, och titta på vad som förbrukas och vad som bildas (så blir nog resten mer greppbart).
2) Om absorbansen ökar eller minskar beror på vid vilken våglängd mäter du absorbansen och vad som bildas genom reaktionen, utan denna information kan vi inte hjälpa dig besvara din fråga.
3) Vet du varför du mäter absorbansen vid detta experiment?
1) Jag fattar vad du menar men vet inte hur jag ska göra
2) NADH på 340 nm
3)
1) Du kan till och med skriva namnen på substraten som enzymet omvandlar (poängen är att du kommer tydligare förstå svaren på 2) och 3) nedan om du ritar ut stegen tror jag).
GAPDH katalyserar två reaktioner, vilka är produkterna? Vilken av dessa produkter kan du detektera bildningen av?
2) Ja, NADH absorberar vid 340 nm (och NAD+ absorberar inte alls vid denna våglängd).
3) Du visar kompendiets text, men varför hjälper det dig att mäta absorbansen vid 340nm?
mag1 skrev:1) Du kan till och med skriva namnen på substraten som enzymet omvandlar (poängen är att du kommer tydligare förstå svaren på 2) och 3) nedan om du ritar ut stegen tror jag).
GAPDH katalyserar två reaktioner, vilka är produkterna? Vilken av dessa produkter kan du detektera bildningen av?
2) Ja, NADH absorberar vid 340 nm (och NAD+ absorberar inte alls vid denna våglängd).
3) Du visar kompendiets text, men varför hjälper det dig att mäta absorbansen vid 340nm?
GAPDH: Glyceraldehyde 3-Phosphate dehydrogenase catalyzes the 6th step of glycolysis – oxidation of Glyceraldehyde 3-Phosphate to 1,3- Biphosphoglycerate via acyline intermediate that phosphorylates orthophosphate to acyl- phosphate.
Detta är från manulen
3) Man letar efter optiskt aktiva molekyler. Fokusera på en molekyl med ett distinkt absorptionsspektrum. En av molekylerna är NADH, NADH har sitt absorbotions maximium vid 340 nm
2) NADH absorberar 340nm.
Min lärare sa "kommer NADH absorbansen att gå upp, ner eller stanna samma, dessa kommer berätta om vad som händer till reaktionen?"
Jag skrev
I experimenten, där GAPDH utlöser reaktionen, kommer reaktionsförloppet att spåras genom att övervaka ökningen av absorbansen för NADH vid 340 nm med UV-vis spektrofotometer. Minskning eller noll absorbansvärde för NADH kommer att indikera "ingen utlösare" i reaktion eller minskning av aktiviteten för glykolys katalytiska enzymer.
Ja, precis koncentrationen av NADH kommer att förändras som en effekt av GAPDH enzymaktivitet.
Så med den information du har om reaktionsblandningens substrat och GAPDH:s aktivitet, kommer absorbansen vid 340 nm öka eller minska?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras?
Med dessa svar tror jag du kan besvara din fråga.
master22 skrev:2) NADH absorberar 340nm.
Min lärare sa "kommer NADH absorbansen att gå upp, ner eller stanna samma, dessa kommer berätta om vad som händer till reaktionen?"
Jag skrev
I experimenten, där GAPDH utlöser reaktionen, kommer reaktionsförloppet att spåras genom att övervaka ökningen av absorbansen för NADH vid 340 nm med UV-vis spektrofotometer. Minskning eller noll absorbansvärde för NADH kommer att indikera "ingen utlösare" i reaktion eller minskning av aktiviteten för glykolys katalytiska enzymer.
De jag har skrivit är det rätt?
mag1 skrev:Ja, precis koncentrationen av NADH kommer att förändras som en effekt av GAPDH enzymaktivitet.
Så med den information du har om reaktionsblandningens substrat och GAPDH:s aktivitet, kommer absorbansen vid 340 nm öka eller minska?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras?
Med dessa svar tror jag du kan besvara din fråga.
Kommer den inte att öka?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras? = har du en källa där jag kan läsa har inte mycket information?
master22 skrev:master22 skrev:2) NADH absorberar 340nm.
Min lärare sa "kommer NADH absorbansen att gå upp, ner eller stanna samma, dessa kommer berätta om vad som händer till reaktionen?"
Jag skrev
I experimenten, där GAPDH utlöser reaktionen, kommer reaktionsförloppet att spåras genom att övervaka ökningen av absorbansen för NADH vid 340 nm med UV-vis spektrofotometer. Minskning eller noll absorbansvärde för NADH kommer att indikera "ingen utlösare" i reaktion eller minskning av aktiviteten för glykolys katalytiska enzymer.
De jag har skrivit är det rätt?
Nästan. Minskar absorbansen vid 340 sker ju något. Är absorbansen oförändrad vet du bara att ingen NADH har bildats - vilket tyder på att ingen reaktion sker.
Förstår inte vad "ingen utlösare" menar. Det är ett enzym du studerar, som katalyserar en kemisk reaktion. Någon utlösare finns inte, men det kanske är vad din lärares favoritord för enzym som är biologiska katalysatorer - vilket är det vedertagna namnet.
Katalys definierades för övrigt av Jöns Jacob Berzelius 1835, och gäller fortfarande för kemiska reaktioner.
master22 skrev:mag1 skrev:Ja, precis koncentrationen av NADH kommer att förändras som en effekt av GAPDH enzymaktivitet.
Så med den information du har om reaktionsblandningens substrat och GAPDH:s aktivitet, kommer absorbansen vid 340 nm öka eller minska?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras?
Med dessa svar tror jag du kan besvara din fråga.
Kommer den inte att öka?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras? = har du en källa där jag kan läsa har inte mycket information?
Hur den kemiska reaktionen ut som ditt enzym GAPDH ger upphov till?
D.v.s vad bildas och vad konsumeras?
Hade du ställt upp detta som en reaktionsformel, hade du nog sett varför NADH absorbansen ändras....
mag1 skrev:master22 skrev:master22 skrev:2) NADH absorberar 340nm.
Min lärare sa "kommer NADH absorbansen att gå upp, ner eller stanna samma, dessa kommer berätta om vad som händer till reaktionen?"
Jag skrev
I experimenten, där GAPDH utlöser reaktionen, kommer reaktionsförloppet att spåras genom att övervaka ökningen av absorbansen för NADH vid 340 nm med UV-vis spektrofotometer. Minskning eller noll absorbansvärde för NADH kommer att indikera "ingen utlösare" i reaktion eller minskning av aktiviteten för glykolys katalytiska enzymer.
De jag har skrivit är det rätt?
Nästan. Minskar absorbansen vid 340 sker ju något. Är absorbansen oförändrad vet du bara att ingen NADH har bildats - vilket tyder på att ingen reaktion sker.
Förstår inte vad "ingen utlösare" menar. Det är ett enzym du studerar, som katalyserar en kemisk reaktion. Någon utlösare finns inte, men det kanske är vad din lärares favoritord för enzym som är biologiska katalysatorer - vilket är det vedertagna namnet.
Katalys definierades för övrigt av Jöns Jacob Berzelius 1835, och gäller fortfarande för kemiska reaktioner.
Behöver jag ändra något här eller verkar det stämma?
mag1 skrev:master22 skrev:mag1 skrev:Ja, precis koncentrationen av NADH kommer att förändras som en effekt av GAPDH enzymaktivitet.
Så med den information du har om reaktionsblandningens substrat och GAPDH:s aktivitet, kommer absorbansen vid 340 nm öka eller minska?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras?
Med dessa svar tror jag du kan besvara din fråga.
Kommer den inte att öka?
Och vad får du reda om reaktionen när NADH absorbansen förändras? = har du en källa där jag kan läsa har inte mycket information?
Hur den kemiska reaktionen ut som ditt enzym GAPDH ger upphov till?
D.v.s vad bildas och vad konsumeras?
Hade du ställt upp detta som en reaktionsformel, hade du nog sett varför NADH absorbansen ändras....
GAPDH katalylserar Glyceraldehyd 3-fosfat till 1,3-bifosfoglycerat och konsumerar två ATP
Är det så?
