Mikrosatelliter i alleler
Mikrosatelliter är korta, repetitiva sekvenser i genomet. På grund av ’slipped strand
mispairing’ blir dessa mutationer ofta mycket variabla och kan användas i tex kriminalteknik
för att identifiera gärningsmän mot ett DNA-spår.
Du får veta att DNA som säkrats vid ett rån har DNA-profilen A2A6 i A-locus (2 resp 6
anger antalet upprepningar av mikrosatelliten). Fyra individer är nu misstänkta för rånet och
deras DNA analyseras.
Vilken av fyra nedanstående individer är mest sannolikt gärningsmannen? (1 HT18)
A. Individ X: CTGAGAGAGAGAGAGCTCG / CTGAGAGAGAGCTCG
B. Individ X: CTGAGAGCTCG / CTGAGAGCTCG
C. Individ X: CTGAGAGAGAGAGAGCTCG / CTGAGAGCTCG
D. Individ X: CTGAGCTCG / CTGAGAGAGAGAGAGCTCG
Enligt facit är svaret alternativ C. Jag antar då att A2A6 inte innebär att det måste vara 2 upprepningar i första allelen och 6 i den andra, utan att det kan vara tvärt om. Däremot ser jag att det i alternativ D finns 2 upprepningar i första och 6 i andra, vilket stämmer bättre överens med hur frågan är formulerad. Varför är D fel men C rätt i detta fall?
Snusmumriken skrev:Mikrosatelliter är korta, repetitiva sekvenser i genomet. På grund av ’slipped strand
mispairing’ blir dessa mutationer ofta mycket variabla och kan användas i tex kriminalteknik
för att identifiera gärningsmän mot ett DNA-spår.
Du får veta att DNA som säkrats vid ett rån har DNA-profilen A2A6 i A-locus (2 resp 6
anger antalet upprepningar av mikrosatelliten). Fyra individer är nu misstänkta för rånet och
deras DNA analyseras.
Vilken av fyra nedanstående individer är mest sannolikt gärningsmannen? (1 HT18)
A. Individ X: CTGAGAGAGAGAGAGCTCG / CTGAGAGAGAGCTCG
B. Individ X: CTGAGAGCTCG / CTGAGAGCTCG
C. Individ X: CTGAGAGAGAGAGAGCTCG / CTGAGAGCTCG
D. Individ X: CTGAGCTCG / CTGAGAGAGAGAGAGCTCG
Enligt facit är svaret alternativ C. Jag antar då att A2A6 inte innebär att det måste vara 2 upprepningar i första allelen och 6 i den andra, utan att det kan vara tvärt om.
Det är inte specificerat vilken sekvens som motsvarar vilken allel, så din tolkning stämmer, du behöver undersöka förekomsten av båda repetitionsfrekvenserna (2/6) i bägge sekvenserna.
Däremot ser jag att det i alternativ D finns 2 upprepningar i första och 6 i andra, vilket stämmer bättre överens med hur frågan är formulerad. Varför är D fel men C rätt i detta fall?
Ta en titt igen, och markera dessa repetitioner...
På tentan kan du bara stryka under repetitionerna, eller på något vis markera dem som enheter/block, vilket ofta gör det lättare att jämföra blockens sekvens och antal. Motsvarande hur det kan blir enklare att se bastripletterna med mellanrum i sekvensen: CTG AGA GAG AGA GAG CTC G
Just det, tack!
