Metylering
Stämmer det att metylering i promotor regionen gör att genen stängs av och om metylering sker i gensekvensen så kommer den initiera transkription?
Metyleringen av DNA är mer av en långvarig process, som i allmänhet sker mycket långsammare än transkription. Majoriteten av våra CpG dinukletotider är metylerade, även utanför "CpG-islands".
Vissa metyleringsmönster löper över generationerna, medans andra ändras i könsceller, och under celldifferentiering. Precis hur (de)metyleringen sker är inte klarlagt, utan ett område det forskas på.
Metylering av DNA i promotorregionen tenderar att sänka uttrycket av den kontrollerade genen. Och sekvenser av DNA med en högre grad av metylering, tenderar att vara "tysta", d.v.s. generna uttrycks inte lika mycket - men undantag finns, inget är svart eller vitt inom biologin.
Effekten av metyleringen av baserna inne i gener är nog ännu mindre beskriven. Men jag skulle inte säga att det leder till att den initierar transkriptionen (det görs ju som bekant i enhancer/repressor, promotor delarna som ligger omkring genen som skall uttryckas).
Metylgrupperna påverkar hur enkelt DNA-modifierande proteiner binder till och verkar på DNA, men effekten beror på proteinet (d.v.s. bättre/sämre), så det låter rimligt att metylering påverkar genuttrycket, men hur denna påverkan sker är mindre beskrivet/känt.
Tack för svar!
Vill du förklara detta mer?
det görs ju som bekant i enhancer/repressor, promotor delarna som ligger omkring genen som skall uttryckas).
För all del!
Det var en kommentar till påståendet i ditt första inlägg:
"om metylering sker i gensekvensen så kommer den initiera transkription"
Det var mest ordet "initiera" som inte passade in, för initieringen av transkriptionen sker genom andra element i DNA än metylerade baser i själva genen. Metyleringen påverkar expressionen upp/ner, genom flera sätt (kondensation, ökad/minskad bindning av proteiner, ändringar i strukturen etcetera) där flera olika element är inblandade. Detaljerna är inte så välbeskrivna än.
Tack snälla!
För all del, kul att det hjälpte!!