Identity och similarity
Någon som skulle kunna förklara vad "identity" (engelska) innebär i sammanhanget sekvensjämförelser mellan tex nucleotid eller aminosyra sekvenser (alltså mellan tex hemoglobins ena kedja och myoglobin)?
Jag förstår inte vad det orden eller smiliarity syftar på här.
Vad tror du själv?
Ta reda på vad orden betyder, och om det inte hjälper googla - för svaret finns där ute. Fastnar du kan du fråga igen, men du behöver kolla lite mer själv först.
Jag har googlat och sökt och googlat lite till - jag hade inte frågat här annars. Jag förstår inte vad det innebär. Jag hittar sidor med ordet men förstår inte sammanhanget.
Vilka sidor har du hittat? Vad är det du inte förstår?
Identity = samma aminosyra på motsvarande plats i de två sekvenserna
Similarity = aminosyra med liknande kemiska egenskaper (polär, sur, aromatisk etc) på motsvarande plats i de två sekvenserna
SvanteR skrev:Identity = samma aminosyra på motsvarande plats i de två sekvenserna
Similarity = aminosyra med liknande kemiska egenskaper (polär, sur, aromatisk etc) på motsvarande plats i de två sekvenserna
Tack!
Räknar man identity och similarity oavsett hur många andra det finns bredvid varandra/totalt i sekvenserna man jämför som är identity/similar? Jag menar såhär, låt säga tex att man jämför två stycken hundra nucleotidsekvenser med varandra och bara 1 av nucleotiderna i ena strängen överensstämmer med 1 i andra strängen. Säger man fortfarande att den har 1% identity då? (apropå att jag tycker det fallet med bara en låter mer som en slump, om man jämför med att tex 32 st överensstämmer
