glykolys
Jag har en fråga angående detta steg i glykolysen. NAD+ reduceras och tar upp två elektroner och två vätejoner. Men var kommer dessa ifrån? Och vad är det för syre som adderas med fosfatgruppen? Kan man kalla hela steget för en additionsreaktion och en oxidation av molekylen?
Din bild är mer av en översiktsbild av de reagerande ämnena, så inte alla delar är utritade i detalj. Det gör det enklare att se vad som sker översiktligt, men en del detaljer behöver man föreställa sig själv.
Om du tittar på vad som sker med substratet (glyceraldehyd-3-fosfat), så ser du att aldehydgruppen (längst ner i din bild) modifieras till en karboxylgrupp, som är kopplad till fosfatgruppen, så att det bildas en fosfoester. Det är i sig en oxidationsreaktion. På aldehydkolet sitter det ett väte (inte utritat), som under oxidationen ersätts av syret som binder till resten av fosfatgruppen.
Det är detta väte som tillsammans med de båda bindningselektronerna i bindningen till aldehydkolet, överförs till NAD+ under oxidationen av substratet. Övergripande ser det ut som att det adderas ett syre från fosforsyran till aldehydkolet under reaktionen, men egentligen (övergripande) substitueras en hydridjon (H-) med en fosfatgrupp.
Rektionen som sker i enzymet är först en oxidation till en karboxylgrupp, vilken frigör den energi som krävs för att sedan binda fosforsyran.
Det går inte att få denna typ av oxidation att ske utan syre, t.ex. när en aldehyd oxideras till en karboxylgrupp kan detta syre vara en den av en vattenmolekyl. I denna reaktion sitter inte syret som reagerar ihop med två väten, utan binder direkt till fosfor, du kan likna det med vatten om det blir enklare att greppa (vatten behåller ju ett av sina väte, motsvarande bindningen mellan O-P i fosfatgruppen).
tack så jättemycket!
För all del kul att det klargjorde!
i steget efter försvinner fosfatgruppen, är det något man måste redogöra? Vart försvinner den?
Mer bildas i det steget, frånsett 3-fosfoglycerat?
Aha ATP? Vänta så fosfatgruppen kommer från när adderas H2PO4 som sedan avgår när det bildas ATP?
Ja precis, den frigjorda energin under oxidationen i steget innan, används för att skapa en energirik fosfoester med en fosfatjon, och bilda 1,3-fosfoglycerat. Och denna energirika bindning, bryts sedan av nästa enzym, samtidigt som en motsvarande energirik bindning bildas mellan fosfatgruppen och ADP, med resultatet att ATP bildas.