5 svar
233 visningar
Kombinatorik behöver inte mer hjälp
Kombinatorik 357 – Fd. Medlem
Postad: 8 apr 2018 01:31

Glukokortikoidreceptor

Hej!

Jag håller på att läsa om hur de olika receptorproteiners struktur är uppbyggda men har svårt att förstå just uppbyggnaden av glukokortikoidreceptor (som binder den hydrofoba kortisolen)

På Wikipedia står det nämligen:

”Like the other steroid receptors,[9] the glucocorticoid receptor is modular in structure ...”

Vad menas med ”modular in structure” i denna mening? (Har försökt slå upp ordet men hittar kommer inte ram till vad frasen betyder)

Sedan står det:

”... contains the following domains (labeled A - F):

...

D - hinge region

Vad menas med ”hinge region” i detta fall?

 

Tack i förhand!

Smaragdalena 80504 – Avstängd
Postad: 8 apr 2018 07:39

"Modular in structure" betyder att proteinet består av flera delar, som sitter ihop ganska löst med varandra. (Modular construction används ganska ofta inom stickning - då gör man en ruta i taget, men den sitter ihop med resten, så att man inte behöver sy ihop hundratals rutor på slutet.)

Hinge betyder gångjärn, så utan att titta specifikt på ditt protein borde det betyda en del av proteinet som är flexibel, så att de andra delarna i proteinet kan röra sig i förhållande till varandra.

Kombinatorik 357 – Fd. Medlem
Postad: 8 apr 2018 12:08
Smaragdalena skrev :

Hinge betyder gångjärn, så utan att titta specifikt på ditt protein borde det betyda en del av proteinet som är flexibel, så att de andra delarna i proteinet kan röra sig i förhållande till varandra.

Har svårt att förstå vad som menas med att en del av proteinet är flexibelt  => de andra delarna i proteinet kan röra sig i förhållande till varandra (flexibla delar?).

Är då hela proteinet flexibelt?

Finns det någon bra förklaraande bild som du kan hänvisa till? (Har sökt på google men ingen bild verkar förklara hinge region principen)

mag1 9562
Postad: 9 apr 2018 16:48

Moduler syftar i detta fall åt att proteinet kan beskrivas som bestående av flera diskreta enheter, som för bl.a. proteiner brukar kallas domäner. Varje domän tillskrivs en unik egenskap, t.ex. att den kan binda en substrat (glukokortikoid i ditt exempel) eller att den kan signallera/reglera aktivitet. 

Gällande glukokortikoidreceptorer består den av domänerna A-F. Där varje domän (eller modul) har en specifik struktur och funktion.

Hela proteinet är inte flexibel utan mellan domänerna C och E återfinns hinge-regionen, vilken tillåter att domängrupperna A-C och E-F att röra sig i förhållande till varandra - t.ex. i samband med substratbindning och därmed möjliggöra en annan interaktion och en effekt efter substratbindning.

Kombinatorik 357 – Fd. Medlem
Postad: 9 apr 2018 18:06
mag1 skrev :

Moduler syftar i detta fall åt att proteinet kan beskrivas som bestående av flera diskreta enheter, som för bl.a. proteiner brukar kallas domäner. Varje domän tillskrivs en unik egenskap, t.ex. att den kan binda en substrat (glukokortikoid i ditt exempel) eller att den kan signallera/reglera aktivitet. 

Gällande glukokortikoidreceptorer består den av domänerna A-F. Där varje domän (eller modul) har en specifik struktur och funktion.

Hela proteinet är inte flexibel utan mellan domänerna C och E återfinns hinge-regionen, vilken tillåter att domängrupperna A-C och E-F att röra sig i förhållande till varandra - t.ex. i samband med substratbindning och därmed möjliggöra en annan interaktion och en effekt efter substratbindning.

1. Kan man alltså säga att hinge regionen är fast på sin position?

2. Extra fråga: Är det så att glukokortikoidreceptorn är den först en monomer men blir till en dimer efter kortisolbindning? I så fall är subenheterna homologa (likadana) med samma domäner?

mag1 9562
Postad: 10 apr 2018 09:12

1. Nja. Hinge-regionen är flexibel och saknar ofta en dominerande struktur. Den fungerar lite som en bit snöre som håller ihop de andra mer strukturella delarna A-C och E-F. I och med att hinge-regionen kan böjas kan de andra domänerna röra sig i förhållande till varandra.

2. Ja glukokortikoidreceptorn dimeriserar efter bindning, och den resulterade homodimeren består av två identiska proteinmolekyler, som var och en består av samma domäner.

Svara
Close