Genetisk varians och selektionstryck

Vad menas med den "genetiska variansen" när man talar om selektionstryck? Är det antalet alleler? Eller antalet fenotyper? Antalet genotyper? För t.ex. när man talar om stabiliserande selektion så står det att det minskar den genetiska variansen. Men om man tänker att det är ett locus med två alleler som är ansvarig för en viss egenskap, så borde ju stabiliserande selektion garantera att genetisk variation (i form av alleler) bibehålls eftersom heterozygoten gynnas.

Samtidigt står det att "riktad selektion" leder till att medelvärdet förändras, eller att populationens genetiska varians skiftar till en ny fenotyp när det uppstår nya miljöomständigheter. Men där borde den genetiska variansen minska väl, eftersom det är möjligt att en homozygot blir gynnad och därmed minskar antalet alleler (eller iallafall frekvensen av vissa alleler, även om den missgynnade allelen kanske finnas kvar i heterozygot form om den är recessiv). 

Eller är det fenotypen man talar om när den genetiska variansen ökar/minskar? Eller genotypen?