Gendrift

hjälparhand skrev:

Hej! Har en fråga som säger att 'du har en manlig mygga som är homozygot (vi säger bb eller BB) för en gendrift på en autosom som du korsar med en sk 'wild type' kvinnlig mygga (Bb ?).

Du får 90 avkommor, hur många av dem är wild type, heterozygot och homozygota?

Om den sista meningen är ifrån din uppgift, så framgår det i denna fråga vilken genotyp som vildtypen har. Kommer du nu fram till honans rätta genotyp?

 

Vad förväntas om gendrift genen är på den kvinnliga myggans autosom istället? 

Eftersom gendriften är på en autsom så spelar det väl ingen roll om den är på den kvinnliga eller manliga myggan?

I och med att frågan ställs kan det antingen vara en kuggfråga, eller så finns det en biologisk skillnad som påverkar den genetiska driften. Jag vet inte på rak arm hur det ser ut med t.ex. ploiditeten för myggornas gameter, men en motsvarande skillnad mellan könen skulle påverka allelfrekvensen hos den driftande genen.

Och avkommorna, eftersom det här är en gendrift så borde väl alla vara homozygota då den allelen favoriseras? Så alla 90 avkommor blir homozygota? 

Nej, vid genetisk drift favoriseras inte det ena anlaget över det andra. För att ett anlag skall favoriseras behöver en selektion för det favoriserade anlaget ske. Vid genetiskt drift sker förändringen av allelfrekvensen istället slumpmässigt, det är en del av definitionen av genetisk drift...

mag1 skrev:

hjälparhand skrev:

Hej! Har en fråga som säger att 'du har en manlig mygga som är homozygot (vi säger bb eller BB) för en gendrift på en autosom som du korsar med en sk 'wild type' kvinnlig mygga (Bb ?).

Du får 90 avkommor, hur många av dem är wild type, heterozygot och homozygota?

Om den sista meningen är ifrån din uppgift, så framgår det i denna fråga vilken genotyp som vildtypen har. Kommer du nu fram till honans rätta genotyp?

 

 

Vad förväntas om gendrift genen är på den kvinnliga myggans autosom istället? 

Eftersom gendriften är på en autsom så spelar det väl ingen roll om den är på den kvinnliga eller manliga myggan?

I och med att frågan ställs kan det antingen vara en kuggfråga, eller så finns det en biologisk skillnad som påverkar den genetiska driften. Jag vet inte på rak arm hur det ser ut med t.ex. ploiditeten för myggornas gameter, men en motsvarande skillnad mellan könen skulle påverka allelfrekvensen hos den driftande genen.

 

Och avkommorna, eftersom det här är en gendrift så borde väl alla vara homozygota då den allelen favoriseras? Så alla 90 avkommor blir homozygota? 

Nej, vid genetisk drift favoriseras inte det ena anlaget över det andra. För att ett anlag skall favoriseras behöver en selektion för det favoriserade anlaget ske. Vid genetiskt drift sker förändringen av allelfrekvensen istället slumpmässigt, det är en del av definitionen av genetisk drift...

Jag ber om ursäkt svenska är inte mitt första språk. Gendrift verkar inte vara det jag menade, i frågan pratar man om 'gene drive' 

Men är den kvinnliga myggan inte Bb? 

Okej, gene drive är en annan sak.

Fick du även frågan på ett annat språk, som t.ex. engelska? Det blir nog enklare om vi vet precis hur frågan var formulerad.

hjälparhand skrev:

Men är den kvinnliga myggan inte Bb? 

Så tolkar jag inte det, baserat på frågan. Men om frågan var annorlunda formulerad eller på t.ex. engelska kan det ha syftat annorlunda.

mag1 skrev:

Okej, gene drive är en annan sak.

Fick du även frågan på ett annat språk, som t.ex. engelska? Det blir nog enklare om vi vet precis hur frågan var formulerad.

Frågan säger " You have a male fruit fly that is homozygous for a gene drive transgene located on an autosome, and you breed it with a wild type female. If 90 offspring are made, how many are expected to be wild type, heterozygous and homozygous? What if the female is homozygous for the gene drive transgene and the male a wild type?"  Hur är man egentligen menad att kunna veta antalet? Det jag förstått om gene drive är att det ökar chansen för allelen att bli nedärv till mer än 50 %

mag1 skrev:

hjälparhand skrev:

Men är den kvinnliga myggan inte Bb? 

Så tolkar jag inte det, baserat på frågan. Men om frågan var annorlunda formulerad eller på t.ex. engelska kan det ha syftat annorlunda.

Om den kvinnliga är BB istället och vi antar att den manliga myggan med gene driven ger sina alleler mer än 50 % av gångerna, blir det då så att vi får 50/50 homozygot och heterozygot istället för att alla blir heterozygota?? Och ingen wild type?

hjälparhand skrev:

mag1 skrev:

Okej, gene drive är en annan sak.

Fick du även frågan på ett annat språk, som t.ex. engelska? Det blir nog enklare om vi vet precis hur frågan var formulerad.

Frågan säger " You have a male fruit fly that is homozygous for a gene drive transgene located on an autosome, and you breed it with a wild type female. If 90 offspring are made, how many are expected to be wild type, heterozygous and homozygous? What if the female is homozygous for the gene drive transgene and the male a wild type?"  Hur är man egentligen menad att kunna veta antalet? Det jag förstått om gene drive är att det ökar chansen för allelen att bli nedärv till mer än 50 %

Ja, med gene drive kan du förvänta dig att det blir det blir mer än 50% av avkomman som får anlaget över tid, det är en definition av gene drive. Hur stor denna ökning är beror på hur transgenen beter sig i myggan. Är dessutom hannen homozygot blir penetransen 100%, som du skrev tidigare.

Hannen i frågan har två kopior den avvikande allelen, d.v.s. transgenen med gene drive. Men honans genotyp är vildtyp och saknar därför helt denna avvikande allelen (transgenen). Istället har honan en(eller två) naturligt förekommande alleler istället - så honan kan inte vara av den genotypen du skrev (Bb).

Tillägg: 8 mar 2022 14:03

En sak till, att gene drive har en högre penetrans än 50% är sett ur ett populationsperspektiv över flera generationer. Även om det i första generationen (G1) "endast" blir 50% penetrans (från korsningen av en individ autosomalt heterozygot för transgenen, och en vildtypsindivid), så kommer penetransen öka i följande generationer G1, G2 o.s.v. och överstiga 50%.

Okej! Så vi kan anta att honan är BB och att alla 90 avkommor blir bb för transgenen. Tack för infon om populationsperspektivet också! 

hjälparhand skrev:

Okej! Så vi kan anta att honan är BB och att alla 90 avkommor blir bb för transgenen. Tack för infon om populationsperspektivet också! 

Nej, om honan är BB så kan inte avkomman bli bb - en av kromosomerna kommer ju ifrån honans BB!

mag1 skrev:

hjälparhand skrev:

Okej! Så vi kan anta att honan är BB och att alla 90 avkommor blir bb för transgenen. Tack för infon om populationsperspektivet också! 

Nej, om honan är BB så kan inte avkomman bli bb - en av kromosomerna kommer ju ifrån honans BB!

Okej då är jag lite förvirrad. Vi har en gene drive med homozygot hane och en vild typ med normala alleler. Myggorna får i första generationen i alla fall en kopia from honan och en från hanen, så alla avkommor kommer ha en allel för gene driven.

 Jag förstår mig bara inte riktigt på hur det ser ut med genotypen. Är honan också homozygot i så fall? Men för två alleler som inte har transgenen på? 

Okej då är jag lite förvirrad. Vi har en gene drive med homozygot hane och en vild typ med normala alleler. Myggorna får i första generationen i alla fall en kopia from honan och en från hanen, så alla avkommor kommer ha en allel för gene driven.

Jag förstår mig bara inte riktigt på hur det ser ut med genotypen. Är honan också homozygot i så fall? Men för två alleler som inte har transgenen på?

Det enda du vet om honans genotyp är att den är vildtyp, d.v.s. honan saknar helt och hållet transgenen. Avkomman kommer få en av honans gener, som då inte är transgenen.

Hanen är homozygot för transgenen (tt). Vi kan för enkelhetens skull anta att honan är homzygot för en vildtypsallell (BB). Avkomman i (G1) kan då endast en genotyp tB, d.v.s. heterozygot för transgenen, du kan dubbelkolla med ett korsningsschema om du inte håller med.

Honan skulle kunnat vara heteozygot för två olika vildtypsalleler (Bb), men det enda du vet från uppgiften är att hanen är homozygot för transgenen (tt) - och det räcker för att besvara frågan om hur fördelningen av transgenen är hos avkomman (homo, hetero, vildtyp).

mag1 skrev:

Okej då är jag lite förvirrad. Vi har en gene drive med homozygot hane och en vild typ med normala alleler. Myggorna får i första generationen i alla fall en kopia from honan och en från hanen, så alla avkommor kommer ha en allel för gene driven.

 

 

Jag förstår mig bara inte riktigt på hur det ser ut med genotypen. Är honan också homozygot i så fall? Men för två alleler som inte har transgenen på?

Det enda du vet om honans genotyp är att den är vildtyp, d.v.s. honan saknar helt och hållet transgenen. Avkomman kommer få en av honans gener, som då inte är transgenen.

Hanen är homozygot för transgenen (tt). Vi kan för enkelhetens skull anta att honan är homzygot för en vildtypsallell (BB). Avkomman i (G1) kan då endast en genotyp tB, d.v.s. heterozygot för transgenen, du kan dubbelkolla med ett korsningsschema om du inte håller med.

 

Honan skulle kunnat vara heteozygot för två olika vildtypsalleler (Bb), men det enda du vet från uppgiften är att hanen är homozygot för transgenen (tt) - och det räcker för att besvara frågan om hur fördelningen av transgenen är hos avkomman (homo, hetero, vildtyp).

Okej det låter logiskt, fattat inte varför det var så svårt att få det gå ihop i huvudet. Det som spelar roll i slutändan är ju avkommans genotyp egentligen. Men verkligen tack för hjälpen med att klura ut den här! 

Varsågod, kul att det hjälpte!

Ibland fastnar man bara i en sätt att betrakta frågan, och går det inte alltid att alternativa tolkningar lika lätt.