extinktionskoefficient
Någon som vet varför vissa proteiner har två extinktionskoefficient?
Gissningsvis gäller de vid olika våglängder. Hemoglobin har exempelvis olika färg om det är "tomt" eller syremättat.
Kan du ge lite mer bakgrundsfakta?
Det handlar om proteinet retinolbindande protein
Number of amino acids: 201
Molecular weight: 23038.8
Theoretical pI: 5.41
Amino acid composition:
Ala (A) 19 9.5% Arg (R) 13 6.5% Asn (N) 9 4.5%
Asp (D) 18 9.0% Cys (C) 6 3.0% Gln (Q) 9 4.5%
Glu (E) 11 5.5% Gly (G) 12 6.0% His (H) 4 2.0%
Ile (I) 6 3.0% Leu (L) 15 7.5% Lys (K) 11 5.5%
Met (M) 5 2.5% Phe (F) 11 5.5% Pro (P) 4 2.0%
Ser (S) 12 6.0% Thr (T) 9 4.5% Trp (W) 6 3.0%
Tyr (Y) 8 4.0% Val (V) 13 6.5% Pyl (O) 0 0.0%
Sec (U) 0 0.0% (B) 0 0.0% (Z) 0 0.0%
(X) 0 0.0%
Total number of negatively charged residues (Asp + Glu): 29
Total number of positively charged residues (Arg + Lys): 24
Atomic composition: Carbon C 1020 Hydrogen H 1547 Nitrogen N 283 Oxygen O 307 Sulfur
S 11
Formula: C1020H1547N283O307S11
Total number of atoms: 3168
Extinction coefficients:
Extinction coefficients are in units of M-1 cm-1, at 280 nm measured in water.
Ext. coefficient 45295 Abs 0.1% (=1 g/l) 1.966, assuming all pairs of Cys residues form cystines
Ext. coefficient 44920 Abs 0.1% (=1 g/l) 1.950, assuming all Cys residues are reduced
Det står ju klart och tydligt vad det är för skillnad:
Extinction coefficients are in units of M-1 cm-1, at 280 nm measured in water.
Ext. coefficient 45295 Abs 0.1% (=1 g/l) 1.966, assuming all pairs of Cys residues form cystines
Ext. coefficient 44920 Abs 0.1% (=1 g/l) 1.950, assuming all Cys residues are reduced
Ok trodde inte att det har var anledningen. Tänk att vissa tenta frågor kan vara så enkla!
Läsförståelse är en grundläggande kunskap, även på universitetsnivå.