0 svar
140 visningar
Quacker 560 – Fd. Medlem
Postad: 18 maj 2019 07:52

Enzymer - katalys - bindningsenergi

"The binding energy is the free energy that is released by the formation of weak interactions between a complementary substrate and enzyme. The binding energy is maximized since only the correct substrate can interact with an enzyme and is released when the enzyme facilitates formation of the transition state. This interaction between the enzyme and the transition state gives way to the maximum binding state. Upon formation of the transition state, the activation energy is lowered, which will speed up the reaction."

 

Vad jag (förhoppningsvis) är med på:

Om två molekyler eller som här substrat och enzym kommer ihop så kan, om de "matchar", de ge ett mer stabilt tillstånd än om de var isär. Om så är fallet så är energinivån (med alla inneboende energier som finns "där i" tex vibrationer och rotationer) lägre för produkten av de två än för vad de hade för energier som separata delar.

Och (dock har jag lite svårt att greppa denna biten: ) då kommer denna energi som de tappar i energi med försvinna ut ur systemet (alltså de två enheterna som gått samman) till omgivningen.

Så om ett substrat och ett enzym har komplementära ytor så kan de två tillsammans vara lägre i energi (som ES) än Enzym och Substrat.

 

Vad jag inte förstår:

När de ungefär halvvägs genom stycket ovan börjar prata om transition state som hänger jag inte med. Mycket tacksam för en förklaring om vad de menar. 

För har inte enzymet och substratet redan i initiala bindningen komplementära ytor - alltså INNAN katalys börjar ske och transition state ("mellan stadiet" mellan reaktant/-er och produkt/-er) uppnås? Så varför verkar de mena på att transition state krävs för att interaktionerna ska vara maximala?...

Men sen den nedre delen: Menar de att transition state för substrat --> produkt UTAN katalyst är en hög-energi-sak. Men när enzymet är där och interagerar med substratet som minskar "ostadigheten" i transition statet, typ så det lugnar ner sig, genom de komplementära "krama om" ytorna mot varandra mellan E och S. Detta gör att substratet hellre vill uppnå transition statet och med det går reaktionen snabbare?

(för att skriva det på mitt lite annorlunda tankesätt ;) )

Svara
Close