Endonukleaser
Hej! Jag är menad att fullborda hela 6 nukleotid sekvensen som en endonukleas (MitIII, påhittad tror jag men en typ II endonukleas) känner igen. Jag får dem 3 första nukleotiderna men så är jag menad att fullborda sekvensen och visa båda DNA strängar samt där den skär som representeras med *. Hade uppskattat hjälp på traven, jag förstår inte hur jag är menad att göra det med bara informationen på bilden
Hej och välkommen till Pluggakuten!
Igenkänningsskvensen (recognition sequence på engelska) är för vissa (endo)nukleas palindroma, och klibbiga överhäng (sticky ends) produceras därför. Så om du tänker dig att du först skapar en komplementär sekvens till den som finns i uppgiften (CA*A) och sedan återskapar (recreate) den palindroma sekvensen. Hur ser det ut då?
Ps. If you by any chance are more comfortable using English, you could try stating your question in English as well. Ds
mag1 skrev:Hej och välkommen till Pluggakuten!
Igenkänningsskvensen (recognition sequence på engelska) är för vissa (endo)nukleas palindroma, och klibbiga överhäng (sticky ends) produceras därför. Så om du tänker dig att du först skapar en komplementär sekvens till den som finns i uppgiften (CA*A) och sedan återskapar (recreate) den palindroma sekvensen. Hur ser det ut då?
Ps. If you by any chance are more comfortable using English, you could try stating your question in English as well. Ds
CA*AGTT Tack! Är det rätt tänkt så här?
GTTCA*A
Nej inte riktigt. Sekvensen med tre deoxynukleotidbaser är komplementär inom gruppen om tre, men den är inte palindrom. Ta en titt på wiki-sidan jag länkade till om det är oklart. Om det ändå inte släpper, kan du fråga igen, men visa då hur långt du kom.
mag1 skrev:Nej inte riktigt. Sekvensen med tre deoxynukleotidbaser är komplementär inom gruppen om tre, men den är inte palindrom. Ta en titt på wiki-sidan jag länkade till om det är oklart. Om det ändå inte släpper, kan du fråga igen, men visa då hur långt du kom.
Jaha! Så det borde vara
CA*ATTG
GTTA*AC
Ja nu stämmer sekvensen för ett typ II endonukleas, och mer precist för typen IIP. Där P står för palindromic - även om sekvensen inte är palindrom utan komplementärt palindrom.
Det finns andra subtyper inom typ II, och ett enzym kan tillhöra flera olika subtyper samtidigt.
mag1 skrev:Ja nu stämmer sekvensen för ett typ II endonukleas, och mer precist för typen IIP. Där P står för palindromic - även om sekvensen inte är palindrom utan komplementärt palindrom.
Det finns andra subtyper inom typ II, och ett enzym kan tillhöra flera olika subtyper samtidigt.
Tack så mycket för hjälpen och extra infon!
För all del, kul att det hjälpte!
Företaget New England Biolabs säljer massvis med nukleaser (och annat som behövs vid t.ex. kloning etcetera), och deras hemsida innehåller en hel del förklaringar och beskrivningar, t.ex. denna
Så det kan vara ett tips om du vill läsa mer om kloningsreagenser och processer.
