Elektrontransportkedjan

Nej, de är inte delar av varandra eller överlappande.

Citronsyracykeln är ett begrepp som sammanfattar de kemiska reaktioner som sker när acetyl-gruppen i acetyl-CoA oxideras till koldioxid. Och under dessa reaktioner reduceras samtidigt NAD⁺ och FAD⁺, till NADH och FADH₂ samt en enhet av GTP bildas.

Och i elektrontransportkedjan ingår de enzymer som krävs för att oxidera NADH och FADH2, en process som tillför den energi som krävs för att pumpa ut vätejoner ut ur mitokondriens inre, till innermembranutrymmet. Och sedan skapas ATP när dessa vätejoner tillåts strömma tillbaka in i mitokondriens matrix.

Men det vi kallar citronsyracykeln och elektrontransportkedjan är inte "fasta system", utan namnen är ett sätt att sammanfatta de kemiska steg som sker (t.ex. när acetyl-CoA leder till bildandet av koldioxid, NADH, FADH₂ och GTP). I själva verket sker dessa kemiska reaktioner i enzymer som finns i mitokondriens matrix, eller i matrixets membran (elektrontransportkedjan). I cellens mitokondrie sitter inte dessa enzymer inte ihop i ett led/cirkel (som de illustreras i läroböckerna, som citronsyracyklen/elektrontransportkedjan). Enzymerna är istället fria och blandade huller om buller - det är molekylerna (t.ex. fumarat) som bildas i ett enzym och diffunderar till ett annat enzym.

Beskrivningarna i läroböckerna visar endast ett urval av allt som sker i cellen, annars skulle det inte gå att greppa riktigt (det sker t.ex. hundratals kemiska reaktioner i en cell endast inom cellens metabolism). I verkligheten är innehållet i cellens cytoplasma och organeller, en väldigt heterogen blandning av tusentals olika: joner, små och stora molekyler. Och dessa  simmar tillsammans runt lösta i vatten eller cellens olika membran.