dNTP vs DNA?
Vad är skällande n mellan dNTP och DNA? För mig verkar de ju fylla samma funktion i PCR reaktioner. Är det samma ska?
"here are four types of dNTP, or deoxynucleotide triphosphate, with each using a different DNA base: adenine (dATP), cytosine (dCTP), guanine (dGTP), and thymine (dTTP). Using dNTP during the extension phase provides single bases ready to go into DNA and double it, like building blocks."
https://www.biochain.com/general/using-dntp-in-polymerase-chain-reaction-pcr/
Från detta citat som jag fick från källan verkar det ju vara samma sak. Är det något jag har missat? Är det samma sak eller skiljer de sig på något sätt?
dNTP är byggstenarna som DNA bildas av. Det är som skillnaden mellan en lös pärla och ett pärlhalsband, typ.
Vänta va? DNA-nukleotider är ju byggstenarna av DNA. De består ju av en kvävebas, 3 fosfatgrupper och en sockerart är inte det samma definition? Skulle inte pärlhalsbandet då vara DNA-molekylen och DNA nukleotiderna pärlorna?
Jag är inte helt säker på att jag förstår din fråga, men dNTP är en sorts nukleotid. Om jag har missförstått får du förklara lite mer vad du menar.
min fråga är att om det finns någon som skiljer DNA-nukleotider från dNTP eller om det är samma sak.
En dNTP är alltid en trisfosfat, med tre fosfatgrupper. Det är därifrån T i förkortningen kommer.
Nukleotid är ett samlingsnamn som används om alla molekyler som innehåller kvävebas, socker och en eller flera fosfatgrupper. Alla dNTP är nukleotider, men alla nukleotider är inte dNTP. I DNA-kedjan är det till exempel bara en fosfatgrupp per nukleotid.
ok, tror jag förstår. Så det du säger om DNAt i DNA molekylen är en nukleotid. Medan DNAt som flyter fritt i PCR är dNTPS eftersom det som skiljer de åt är antalet fosfatgrupper. Enligt definition av dNTPS så bör fosfatgruppen vara 3 för att vara en dNTP? Så när DNA-nukleotider i fri form så är de även dNTPS eftersom de innehåller 3 fosfat grupper. Stämmer detta?
Nästan! Alla nukleotider som ska användas till DNA-syntes måste innehålla tre fosfatgrupper. Men om DNA bryts ned kommer man att få nukleotider som bara innehåller en fosfatgrupp. De kan då inte användas till DNA-syntes förrän cellen har satt på nya fosfatgrupper.
Har du några andra exempel på andra nukleotider som inte är dNTP
dNTP innehåller ju deoxyribos. Sedan finns ju NTP som innehåller ribos och som används till RNA. De är också nukleotider. Engelska wikipedia har flera exempel på nukleotider som inte finns i varken DNA eller RNA.
https://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotide (bilden med rubriken "Examples of non-nucleic acid nucleotides")