7 svar
71 visningar
manne1907 158
Postad: 5 jan 16:53

Deaminering i gen som transkriberas efter en replikation

Bilden visar en gensekvens som innehåller startkodonet för ett protein (A), samt den genetiska koden (B).

Vad händer med proteinet i fråga om den understrukna basen blir deaminerad, men ej reparerad, och genen transkriberas efter en replikation?



 

A) Det bildas ett förkortat protein

 
 
 

B) Proteinet innehåller en Gln→Lys substitution

 
 

C) Det bildas ett förlängt protein

 
 

D) Proteinet innehåller en Ala→Glu substitution

Jag missförstår mig kanske, men från början ska det vara CAG, vilket motsvarar glycin. Efter deaminering borde det ju bli UAG, och efter en replikation borde det väl då vara ATC? Borde det inte vara en glycin till isoleucine substitution? Rätt alternativ är B. Mvh

mag1 9478
Postad: 6 jan 15:18
manne1907 skrev:

Jag missförstår mig kanske, men från början ska det vara CAG, vilket motsvarar glycin.

Glu=Glutaminsyra

Efter deaminering borde det ju bli UAG, och efter en replikation borde det väl då vara ATC? Borde det inte vara en glycin till isoleucine substitution? Rätt alternativ är B. Mvh

Inte riktigt med på hur du tänker nu, eller vilken sträng du menar med ATC.

Efter deaminieringen blir den understrukna basen U, som du skrev. Men vad händer under replikationen med detta U?

manne1907 158
Postad: 6 jan 15:29
mag1 skrev:
manne1907 skrev:

Jag missförstår mig kanske, men från början ska det vara CAG, vilket motsvarar glycin.

Glu=Glutaminsyra

Efter deaminering borde det ju bli UAG, och efter en replikation borde det väl då vara ATC? Borde det inte vara en glycin till isoleucine substitution? Rätt alternativ är B. Mvh

Inte riktigt med på hur du tänker nu, eller vilken sträng du menar med ATC.

Efter deaminieringen blir den understrukna basen U, som du skrev. Men vad händer under replikationen med detta U?

CAG = Gln = Glycin väl? 
Efter deaminering fås UAG, men kommer inte detta under replikation bli de komplementära basparen; dvs ATG? Eller är det bara att det blir AAG?

mag1 9478
Postad: 6 jan 19:08

Vi ser inte hela sekvensen tror jag. För om det inte finns ett till startkodon till vänster utanför bilden, blir det svårt att få att alternativ B är rätt.

 

manne1907 skrev:
mag1 skrev:
manne1907 skrev:

Jag missförstår mig kanske, men från början ska det vara CAG, vilket motsvarar glycin.

Glu=Glutaminsyra

Efter deaminering borde det ju bli UAG, och efter en replikation borde det väl då vara ATC? Borde det inte vara en glycin till isoleucine substitution? Rätt alternativ är B. Mvh

Inte riktigt med på hur du tänker nu, eller vilken sträng du menar med ATC.

Efter deaminieringen blir den understrukna basen U, som du skrev. Men vad händer under replikationen med detta U?

CAG = Gln =

Ja.

Glycin väl? 

Nix, kolla tabellen i biokemiboken en gång till...

 

Efter deaminering fås UAG, men kommer inte detta under replikation bli de komplementära basparen; dvs ATG?

Nej det stämmer inte riktigt med basparningen, den tredje positionen basparar mot C, i den komplementära strängen, d.v.s. sekvensen blir ATC.

manne1907 158
Postad: 6 jan 19:32
mag1 skrev:

Vi ser inte hela sekvensen tror jag. För om det inte finns ett till startkodon till vänster utanför bilden, blir det svårt att få att alternativ B är rätt.

 

manne1907 skrev:
mag1 skrev:
manne1907 skrev:

Jag missförstår mig kanske, men från början ska det vara CAG, vilket motsvarar glycin.

Glu=Glutaminsyra

Efter deaminering borde det ju bli UAG, och efter en replikation borde det väl då vara ATC? Borde det inte vara en glycin till isoleucine substitution? Rätt alternativ är B. Mvh

Inte riktigt med på hur du tänker nu, eller vilken sträng du menar med ATC.

Efter deaminieringen blir den understrukna basen U, som du skrev. Men vad händer under replikationen med detta U?

CAG = Gln =

Ja.

Glycin väl? 

Nix, kolla tabellen i biokemiboken en gång till...

 

Efter deaminering fås UAG, men kommer inte detta under replikation bli de komplementära basparen; dvs ATG?

Nej det stämmer inte riktigt med basparningen, den tredje positionen basparar mot C, i den komplementära strängen, d.v.s. sekvensen blir ATC.

Ja förlåt, ATC menade jag. Men det ATC ger ju fel aminosyra? Rätt svar är Gln -> Lys 

mag1 9478
Postad: 7 jan 14:24

Då är väl frågan vilket som är startkodonen i sekvensen? Det finns ett ATG i sekvensen du infogat, men det finns även baser uppströms (till vänster i bilden). Så sekvensen i bilden kan vara i flera olika "frames", där olika tripletter bildas motsvarande:

C  AAT  GGA   GCA  GC...

CAA TGG AGC AGC...

CA  ATG  GAG  CAG  C...

 

Det var därför jag frågade om det finns mer av sekvensen - eftersom bilden är "croppad" på vänstersidan.

manne1907 158
Postad: 7 jan 15:44
mag1 skrev:

Då är väl frågan vilket som är startkodonen i sekvensen? Det finns ett ATG i sekvensen du infogat, men det finns även baser uppströms (till vänster i bilden). Så sekvensen i bilden kan vara i flera olika "frames", där olika tripletter bildas motsvarande:

C  AAT  GGA   GCA  GC...

CAA TGG AGC AGC...

CA  ATG  GAG  CAG  C...

 

Det var därför jag frågade om det finns mer av sekvensen - eftersom bilden är "croppad" på vänstersidan.

Oj, såg ej att det var croppat. Här kommer den hela bilden: 

manne1907 158
Postad: 7 jan 15:54 Redigerad: 7 jan 15:55
mag1 skrev:

Då är väl frågan vilket som är startkodonen i sekvensen? Det finns ett ATG i sekvensen du infogat, men det finns även baser uppströms (till vänster i bilden). Så sekvensen i bilden kan vara i flera olika "frames", där olika tripletter bildas motsvarande:

C  AAT  GGA   GCA  GC...

CAA TGG AGC AGC...

CA  ATG  GAG  CAG  C...

 

Det var därför jag frågade om det finns mer av sekvensen - eftersom bilden är "croppad" på vänstersidan.

En spontan tanke: Eftersom det bara finns ett startkodon kommer sekvensen som cytosinet tillhöra vara CAG och aminosyran som ursprungligen skulle vara där att vara Gln. Efter deaminering kommer detta leda till UAG. För mig kan det härifrån finnas två scenarion: 

1) Efter replikation kommer UAG komplementärt bespara för att bilda ATC (Isoleucin) eller 2) Under replikation kommer uracilet att repareras av DNA-polymeraset och bilda AAG. Om det är alternativ 2, förstår jag varför alternativ B stämmer. Om det inte är alternativ 2 så förstår jag inte hur det skulle fungera isåfall. 

Svara
Close