Biokemi aminosyror
Jag har svårt med frågan "Hur vet man vilken jon som är vanligast i en vattenlösning av en aminosyra?". Jag vet att det beror på pH och att jonerna i vattenlösning av aminosyror består av den oprotolyserade aminosyran, den negativa jonen, den positiva jonen och amfojonen. Men vad innebär ett lågt/högt pH för vilka joner som är vanligast?
Aminosyrornas gemensamma del (d.v.s. allt förutom sidokedjan/R-gruppen) bilar en amfojonformen vid neutralt/fysiologiskt pH. Detta då karboxylsyragruppen protolyseras och aminogruppen tar upp en proton. Så aminosyrans laddning beror vid neutralt pH på vilken sidokedjan är. Sura sidokedjor protolyseras (minus ett laddning), och basiska tar upp en proton (plus ett laddning).