Binding motifs funktion
Okej, kan inte för livet förstå mig på funktionen och hur de binder till DNA. Förstår att det finns några olika sorter som Zn fingers, Leucine zippers och homedomains och att de på något sätt reglerar DNA, men vad reglerar de med DNA? Transkriptionen? Sedan hur binder de är det waals bindingar eller kovalenta?
De proteintyper du nämner tillhör transkriptionsfaktorer (inte alla är detta dock, men gemensamt för de tre typerna är att de kan agera som transkriptionsfaktorer, d.v.s. det finns zink-fingrar som inte binder till DNA/RNA utan till andra partiklar).
Transkriptionsfaktorer är väl beskrivna på t.ex. Wikipedia, så där finns mer att läsa om dessa.
Det är dock inte fråga om någon kovalent bindning till DNA, det skulle skapa en DNA-addukt som skulle störa andra processer som t.ex. replikation, reparation, kromatinkondensation etcetera. Utan interaktionerna är via väte- och Van der Waals interaktioner.
hur spelar riboswitches in i detta?
RisPris skrev:hur spelar riboswitches in i detta?
Hur skulle du beskriva riboswitches?
På vilken typ av ämne är riboswitches aktiva?
Okej, riboswitches funkar ju på RNA så inget med DNA att göra så rent teoretiskt ingenting att göra. Fattar inte riktigt hur de fungerar, är det så att de är en sekens av RNA som kan vika in sig på sig själv och bildar då en ugla? Är det då ett antiparallel palindrom likt transcription termination av E.coli eller hur skiljer de sig? Sedan har jag även förstår att de måste binda in till transcription repressor proteins för att de skall kunna reglerar proteinet.
Det jag tror de har gemensamt är väl att båda är transkriptions reglerande.
Hur riboswitches fungerar är lite mer komplicerat, men väl beskrivet t.o.m. på Wikidpediasidan. De kan dock påverkar både transkription- och translationsprocesserna - av det protein som mRNA:t kodar för eller en annan genprodukt.
