Begreppsförvirring proteiner
Hej! Jag är väldigt förvirrad gällande begrepp för proteiner kopplat till dess konformation.
1.Hur skiljer man på motiv, subenhet och domän?
2. Vad är skillnaden av vad tertiär strukturen och kvartnär strukten beskriver?
Bilder uppskattas att det blir lättare att förstå:)
För att ta dem i storleksordning, så är motivet minst, domänen större och subenheten störst.
Ett motiv är en liten strukturell eller funktionell enhet inom ett protein. Ofta syftar det på en specifik peptidsekvens, som kanske finns i flera proteiner och fyller samma funktion, eller kan finnas på flera ställen i samma protein.
En domän är en relativt självständig tredimensionell del av en proteinstruktur, som kan utföra en specifik funktion på egen hand. De aminosyrarester som ingår i domänen behöver inte ligga i följd utan domänen kan bildas av aminosyror som ligger långt från varandra i primärstrukturen men som genom veckningen hamnat intill varandra.
Subenheter består alltid av separata peptidkedjor, som gemensamt bildar ett protein. Mellan subenheterna kan det finnas både intermolekylära krafter, saltbryggor och disulfidbryggor. De fyra subenheterna i hemoglobin är ett exempel.
Tack så mycket för svar:)
Så det gäller alltså
Storlek: Motiv—> Subenhet—> domän
Hur kopplas detta till tertiär och kvartnär struktur? Vilka enheter beskrivs av vad?
Nej, en subenhet är den största av de där tre. Subenheterna är de delar som ingår i kvartärstrukturen. Motiv och domän är på sätt och vis ett annat sätt att benämna intressanta delar i proteinet, som ligger vid sidan av primärstruktur, sekundärstruktur o.s.v. Men i princip är motiv vanligen en del av primärstrulturen och en domän en del av tertiärstrukturen.
