Att en gen går från 5' till 3' riktning
Hej!
Jag har försökt hitta informationen angående vad den innebär att en gen går från riktningen 5' till 3' men jag verkar inte kunna hitta något information om det. (Det står bokstavligen ingenting om det i boken) Så jag undrar vad innebär det att en gen går från 5' till 3' riktning? Och sen nämns det också att "Om en RNA-polymeraset transkriberar från vänster är den undre strängen mall", vad innebär att den nedre strängen är mall?
Tack på förhand!
Den dubbelsträngade DNA-molekylen kan betraktas från två håll (båda ändarna), och samtidigt finns det två strängar. En den kodande (sense på engelska, även kallad "övre strängen") och den komplementära (antisense, eller undre strängen). Så för att kunna beskriva vilket håll och sträng som beskrivs, för t.ex. var en gen finns i DNA så utgår man ifrån den kodande strängen och i riktningen 5´till 3´.
Nukelotidbaserna som kodar för t.ex. ett protein ligger efter varandra, där 5´och 3´refererar till hydroxigrupperna på deoxyribossockret (röda i bilden). På så vis kan riktningen anges, och sekvensen behöver endast anges en gång i 5´till 3´riktningen (den komplementära strängen är just komplementär så sekvensen av endast en sträng behövs).
I bilden är sekvensen 5´till 3´= TAA.
RNA polymeraset (RNAP i bilden) syntetiserar mRNA med antisensesträngen som templat, då detta enzym syntetiserar mRNA i riktningen 5´-3´. Riktningen i DNA (svart) är angiven med 5' till vänster. Och för det syntetiserade mRNA (blå).
I början var strängen 5'-3' dvs den övre strängen var 5' och nedre strängen 3'. Efter att RNAP kommer och "låste upp" RNA:t så kommer att 3' strängen som är den nedre delen att koda sig mig 5', korrekt? Och riktningen är från 5' till 3' va?
Lite knepigt att vet precis vad du menar, då det t.ex. finns 5´på både DNAs bägge strängar och på mRNA. Men jag tror jag förstår vad du säger .
I början var sense DNA strängen 5'-3' dvs den övre strängen var 5' och nedre strängen 3'. Efter att RNAP kommer och "låste upp" RNA:t så kommer att 3' antisense strängen i DNA som är den nedre delen att koda sig mig 5', för RNA-polymerasets syntes av mRNA korrekt? Och riktningen är från 5' till 3' va?
Var det så här du menade? Det är lite klurigt att hålla isär att olika strängar och deras riktningar.
mag1 skrev:Lite knepigt att vet precis vad du menar, då det t.ex. finns 5´på både DNAs bägge strängar och på mRNA. Men jag tror jag förstår vad du säger .
I början var sense DNA strängen 5'-3' dvs den övre strängen var 5' och nedre strängen 3'. Efter att RNAP kommer och "låste upp" RNA:t så kommer att 3' antisense strängen i DNA som är den nedre delen att koda sig mig 5', för RNA-polymerasets syntes av mRNA korrekt? Och riktningen är från 5' till 3' va?
Var det så här du menade? Det är lite klurigt att hålla isär att olika strängar och deras riktningar.
Hej!
Jag lyckades fråga min lärare och tror jag har en bättre bild över 5'-3'. Tack för din hjälp :D!
