ATP i replikationen
Vid replikationen så kommer ju nukleotider med 3 fosfatgrupper att binda in till respektive sträng med DNA-polymeras 3, men innan själva inbindningen så klipps 2 fosfatgrupper bort. Jag antar att det fungerar ungefär likadant vid transkriptionen, förutom att det då är RNA-nukleotider som binds in (vet att det är RNA-polymeras istället o.s.v.), att nukleotiderna ursprungligen har 3 fosfatgrupper. ATP består ju utav ribos, adenin och 3 fosfatgrupper. Innebär inte det att adenin-nukleotiden som används för att bilda mRNA ursprungligen är ATP?
sund20 skrev:Vid replikationen så kommer ju nukleotider med 3 fosfatgrupper att binda in till respektive sträng med DNA-polymeras 3, men innan själva inbindningen så klipps 2 fosfatgrupper bort.
Nej, de två fosfatgrupper som sitter ytterst på t.ex. dATP försvinner i samband med att DNA-polymeraset bildar den nya bindningen till den nya nukleotiden. Vid inbindningen är det alltid trifosfatformen, för den energirika bindningen mellan fosfatgruperna 1 och 2 behövs för att bilda den nya fosofodiesterbindningen i den framväxande nya strängen av DNA.
Jag antar att det fungerar ungefär likadant vid transkriptionen, förutom att det då är RNA-nukleotider som binds in (vet att det är RNA-polymeras istället o.s.v.), att nukleotiderna ursprungligen har 3 fosfatgrupper. ATP består ju utav ribos, adenin och 3 fosfatgrupper. Innebär inte det att adenin-nukleotiden som används för att bilda mRNA ursprungligen är ATP?
Ja precis det är ATP som används som material för adeninnukleotiden i mRNA.
mag1 skrev:sund20 skrev:Vid replikationen så kommer ju nukleotider med 3 fosfatgrupper att binda in till respektive sträng med DNA-polymeras 3, men innan själva inbindningen så klipps 2 fosfatgrupper bort.
Nej, de två fosfatgrupper som sitter ytterst på t.ex. dATP försvinner i samband med att DNA-polymeraset bildar den nya bindningen till den nya nukleotiden. Vid inbindningen är det alltid trifosfatformen, för den energirika bindningen mellan fosfatgruperna 1 och 2 behövs för att bilda den nya fosofodiesterbindningen i den framväxande nya strängen av DNA.
Jag antar att det fungerar ungefär likadant vid transkriptionen, förutom att det då är RNA-nukleotider som binds in (vet att det är RNA-polymeras istället o.s.v.), att nukleotiderna ursprungligen har 3 fosfatgrupper. ATP består ju utav ribos, adenin och 3 fosfatgrupper. Innebär inte det att adenin-nukleotiden som används för att bilda mRNA ursprungligen är ATP?
Ja precis det är ATP som används som material för adeninnukleotiden i mRNA.
Så ATP används både vid transkriptionen och vid som energibärare? När ATP används som energibärare, hur är energin lagrad (eller snarare hur frigörs den)? Har för mig att fosfatgrupper klipps bort, men varför frigörs då energi?
Ja ATP används både som energikälla och som substrat under transkriptionen.
Energin används på samma vis, bindningen (fosfoanhydridbindning) mellan fosfatgrupperna klyvs. I och med att mono- eller di-fosfatgruppen är en väldigt bra lämnande grupper kan den stora energimängden i bindningarna användas till många olika reaktioner från: att bilda en ny bindning (som i mRNA), till att driva en annan kemisk reaktion eller till att få ett protein att ändra konformation lite (som sker för myosin i musklerna när de drar ihop sig).
