Är det möjligt att extrahera DNA ur döda växtceller?
Hej!
Jag håller på med en labb där jag ska extrahera DNA ur växtceller. Jag håller på sammanfatta mina försök under avsnittet diskussioner, kring de resultat jag fått fram, just nu.
Labb: Blanda diskmedel, mossade ärtor, salt, vatten. Filtrera blandningen genom ett kaffefilter och en tratt i en ny bägare. Häll över iskall T-röd på "ärtblandningen" och fiska sedan upp DNA-strängar med en träpinne som slutligen kommer framträda ur lösningen som filtrerats.
jag har inte lyckats med försöket ännu och har lite olika tankar kring vilka felkällorna möjligen kan vara.
Min fråga är nu; Är det möjligt att extrahera DNA ur döda växtceller? Om cellerna är "döda" skulle man alltså kunna extrahera DNA fortfarande med denna typ av försök?
jag vill egentligen bara ha ett JA eller NEJ på frågan ovan, om det ens är möjligt för att kunna fortsätta skriva på min diskussion.
Oerhört tacksam för svar! Oavsett om era svaren bara är gissningar kan de kanske ge mig ledtrådar till goda slutsatser.
Det här är mitt resultat. Är DNA den vita fällningen?
Varför väljer man just denatuerad alkohol?
Kan kaffefilter som innehåller bly påverka resultatet, om man filtrerar blandningen - Hur kan man observera detta på bilden?
Ge gärna en "kemisk" förklaring till syftet med laborationen, "extrahera DNA ur ärtor", - vad är det jag förväntas upptäcka?
jag har förstått att;
Växtcellerna separeras vid mossningen, tensiderna öppnar cellernas ytter och innermembran (kärnmembran), cellulosa är gjort av växtfett (cellmembranet), saltet fångar upp trasiga organeller och trasigt protein, kolhydrater som inte fastnar på DNA.
Det är MYCKET ett hålla reda på just nu. Växlar mellan biologiboken och kemiboken i hoppet om att jag ska få ihop denna laboration. Därav de lösa frågorna.
Teraeagle skrev:Ja!
Tack för svar!
cellulosa är gjort av växtfett
Nej, cellulosa är en kolhydrat - en massa glukosringar som sitter ihop med varandra.
Miss_Arctic_Altitude skrev:Det här är mitt resultat. Är DNA den vita fällningen?
Det vita ser ut som DNA, men det är svårt att se detaljerna i bilden dock. Om du får alla steg att fungera väl bör du försiktigt kunna dra upp DNA i vitaktiga trådar.
Varför väljer man just denatuerad alkohol?
Alkohol (etanol) som används som så gott som alltid denaturerad, frånsett när det inte går att ha med det/de ämnen som används för att denaturera alkoholen (denatureringsämnena kan störa t.ex. vissa kemiska reaktioner, eller påverka vi spektrofotomatri). Alkoholen denatureras för att undvika att personer med alkoholmissbruksproblem dricker alkoholen. Att den var denaturerad är ett skäl till att ni som studenter fick använda den, och att vem som helst kan köpa denaturerad etanol.
Kan kaffefilter som innehåller bly påverka resultatet, om man filtrerar blandningen - Hur kan man observera detta på bilden?
Om filtret innehåller bly, bör det i så fall läcka ut som blyjoner, men detta kan du inte se i bilden. Blyjonerna är positiva och DNA har massor av negativa fosfatgrupper, som kommer bilda komplex med eventuella blyjoner.
Ge gärna en "kemisk" förklaring till syftet med laborationen, "extrahera DNA ur ärtor", - vad är det jag förväntas upptäcka?
Ja vad tror du själv är syftet med laborationen? Börja där så kanske vi kan hjälpa dig vidare.
mag1 skrev:Miss_Arctic_Altitude skrev:Det här är mitt resultat. Är DNA den vita fällningen?Det vita ser ut som DNA, men det är svårt att se detaljerna i bilden dock. Om du får alla steg att fungera väl bör du försiktigt kunna dra upp DNA i vitaktiga trådar.
Varför väljer man just denatuerad alkohol?
Alkohol (etanol) som används som så gott som alltid denaturerad, frånsett när det inte går att ha med det/de ämnen som används för att denaturera alkoholen (denatureringsämnena kan störa t.ex. vissa kemiska reaktioner, eller påverka vi spektrofotomatri). Alkoholen denatureras för att undvika att personer med alkoholmissbruksproblem dricker alkoholen. Att den var denaturerad är ett skäl till att ni som studenter fick använda den, och att vem som helst kan köpa denaturerad etanol.
Kan kaffefilter som innehåller bly påverka resultatet, om man filtrerar blandningen - Hur kan man observera detta på bilden?
Om filtret innehåller bly, bör det i så fall läcka ut som blyjoner, men detta kan du inte se i bilden. Blyjonerna är positiva och DNA har massor av negativa fosfatgrupper, som kommer bilda komplex med eventuella blyjoner.
Ge gärna en "kemisk" förklaring till syftet med laborationen, "extrahera DNA ur ärtor", - vad är det jag förväntas upptäcka?
Ja vad tror du själv är syftet med laborationen? Börja där så kanske vi kan hjälpa dig vidare.
Tack för svar!
Jag var inne och snurrade lite på begreppet "denatuerad" om enzymet DNase i växtceller fungerar på liknande vis vid en viss temperatur, som albumin i äggvita där de hydrofoba R-grupper vilka vänds utåt vid stekning (denatueras), vätebindningarna bryts.
Är DNA-strängarna man ska fiska upp dubbelhelixar man ser i den där soppan?
Alkoholen är denaturerad för att undvika att människor dricker den. Men den denaturerar så klart även proteiner, men i din laboration har den en annan roll - den används för att få DNA att fälla ut och bilda det via olösliga DNA du såg.
Ja DNA kommer vara i form av den klassiska dubbelhelixen, precis som den är i ärtornas kromosomer.
Skall du lyckas fiska upp strängar behöver du vara varsam (mosa varsamt, inte vispa runt för mycket), för även om DNA är i formen av en dubbelhelix är det fortfarande endast en tunn polymer. Det går att slita sönder DNA bara genom att suga upp det några gånger med en spruta med nål, eller om du verkligen kör ärtorna i en mixer. Jag vet inte om det är tänkt att ni skall kunna fiska upp DNA-strängar under er laboration, för det är inte så enkelt.
mag1 skrev:Alkoholen är denaturerad för att undvika att människor dricker den. Men den denaturerar så klart även proteiner, men i din laboration har den en annan roll - den används för att få DNA att fälla ut och bilda det via olösliga DNA du såg.
Ja DNA kommer vara i form av den klassiska dubbelhelixen, precis som den är i ärtornas kromosomer.
Skall du lyckas fiska upp strängar behöver du vara varsam (mosa varsamt, inte vispa runt för mycket), för även om DNA är i formen av en dubbelhelix är det fortfarande endast en tunn polymer. Det går att slita sönder DNA bara genom att suga upp det några gånger med en spruta med nål, eller om du verkligen kör ärtorna i en mixer. Jag vet inte om det är tänkt att ni skall kunna fiska upp DNA-strängar under er laboration, för det är inte så enkelt.
Jo det är meningen att jag ska "plocka upp DNA" men jag skippar det momentet, jag ser vad som flyter på min "observationsyta" (svarta bakgrunden) och får utgå ifrån att det är DNA jag extraherat.
Kiwi är optimalt, förövrigt, ärtorna var besvärliga, uppfattade mest skum ifrån diskmedlet vid ärtförsöken.
min slutsats blir att det är det är utnyttjandet av de olika ämnenas löslighet, temperatur som möjliggör extraktionen och slutligen kan resultatet förklaras vidare med ämnenas inneboende egenskaper; polaritet och hur bindningarna kan brytas eller tillkomma, samverka eller motverkas av särskilda enzymer.
jag har inte skrivit det exakt så "platt", som det lät ovan. Jag har snurrat ytterligare några varv kring relaterat material i ämnet, snart i mål!
Tack för alla svar!
Du kan absolut plocka upp materialet med t.ex. en ätpinne eller tandpetare, men som DNA såg ut på bilden blir nog inga trådar snarare klumpar.
Precis det är en kombination av stegen, i rätt ordning som ger DNA. Cellerna lyseras och DNA hamnar i vätskan, filtreringen tar bort ärtrester, och den kalla etanolen får DNA att falla ut. Några enkla steg och så har du DNA (det är inte superrent men enkelt utplockat från ärtornas cellkärnor och separerat från det mesta av cellens andra delar).
Varsågod!
