aminosyror protolys
Hej jag skulle behöva hjälp hur aminosyran Asparagin och Arginin ser ut i basisk/sur lösning. Hur ser deras NH2-grupper på sidokedjorna ut. Skulle vara god hjälp med en bild!
Och i t.ex Histidin finns en NH på sidokedjan, kommer denna protolyseras och bli NH2+ i en sur lösning?
Du kan börja med att söka efter bilder, det borde finnas massvis med exempel att hitta, om du söker.
mag1 skrev:Du kan börja med att söka efter bilder, det borde finnas massvis med exempel att hitta, om du söker.
Faktiskt inte, det är därför jag kom hit med förhoppning om en förklaring.
itter skrev:mag1 skrev:Du kan börja med att söka efter bilder, det borde finnas massvis med exempel att hitta, om du söker.
Faktiskt inte, det är därför jag kom hit med förhoppning om en förklaring.
Vilka söktermer använde du?
Svenskan är lite begränsad, i.o.m. att vi inte är så många, men om du provar att söka på engelska finns det träffar. Jag fick massvis med följande söktermer
"Asparagine charge different pH"
Bilderna visar med stort resultat amfojonerna av dessa eller inte hur sidogruppen påverkas, hittar inte tydliga bilder på dessa i syra/basiska lösningar.
Vilken amfojon som bildas är beroende av pH, och om du vet laddningen vid surt/basiskt pH, kan du lista ut vilken laddningen är.
förstår inte riktigt varför NH vid dubbelbindningen i Arginin är den enda som blev laddad? Jämfört med i Histidin där båda är laddade??
Kolla igen, det är precis samma antal positiva laddningar i båda ämnena, likaså med de negativa laddningarna.
mag1 skrev:Kolla igen, det är precis samma antal positiva laddningar i båda ämnena, likaså med de negativa laddningarna.
Förstår endast inte varför både NH och N blev laddade i Histidin och bara just det dubbelbundna NH i Arginin. t.ex varför blev inte NH2 gruppen i Arginin laddad till NH3?
Räkna antalet bindningar som kväveatomen har. Ser du någon trend, som kanske påminner om ammoniak/ammoniumjonen?
mag1 skrev:Räkna antalet bindningar som kväveatomen har. Ser du någon trend, som kanske påminner om ammoniak/ammoniumjonen?
Ja..
Och kolatomen som ammoniumgrupperna binder till i arginins sidokedja har fyra bindningar, varav två till den ena ammoniumgruppen och endast en till den andra. Så ammoniumgrupperna har inte samma antal bindningar, därav skillnaden i fria elektronpar och därmed laddningen.
mag1 skrev:Och kolatomen som ammoniumgrupperna binder till i arginins sidokedja har fyra bindningar, varav två till den ena ammoniumgruppen och endast en till den andra. Så ammoniumgrupperna har inte samma antal bindningar, därav skillnaden i fria elektronpar och därmed laddningen.
hur blir det med asparagin (den har en polär sidokedja men den har en NH2 grupp), kommer den bli NH3+ i sur lösning? Hittar inget om hur det blir med sådana sidokedjor, Till exempel i nedanstående bild står det systern kan SH bli S-? 
Amidgruppen i asparagins sidokedja tar helt enkelt inte upp en proton. Precis som kväveatomen i peptidbindningen mellan två aminarester (även det en typ av amidbindning). Anledningen till detta är att dubbelbindningen till syreatomen, kan omlagras och en dubbelbindning kan tillfälligt skapas mellan kvävet och syret, motsvarande resonans. Men merparten av tiden kommer dubbelbindningen att finnas mellan syret och kolet, då detta är mer stabilt.
