Aminosyror
I en vetenskaplig artikel från 2020 upptäckte man att det så kallade spike-proteinet i SARS-CoV-2, blir fosforylerat på aminosyran i position 578, då det uttrycks i värdcellerna. En hypotes som sattes upp är att fosforyleringen påverkar spike-proteins interaktion med en receptor på ytan av värdcellerna.
Vilken aminosyra är mest lämplig att substituera amiosyra 578 med, om man vill härma fosforyleringen och studera dess roll?
Glutaminsyra
Serin
Tyrosin
Aspargin
Här tänkte jag att svaret skulle vara antingen serin eller tyrosin eftersom dessa kan fosforyleras, men svaret är glutaminsyra med motiveringen att det är negativt laddat. Jag förstår dock inte varför eftersom jag tolkar frågan som att man vill ha en annan aminosyra som kan fosforyleras. Jag förstår att fosfat är negativt laddat, men menar de då att de ska studera glutaminsyra istället för aminosyra 578?
Snusmumriken skrev:I en vetenskaplig artikel från 2020 upptäckte man att det så kallade spike-proteinet i SARS-CoV-2, blir fosforylerat på aminosyran i position 578, då det uttrycks i värdcellerna. En hypotes som sattes upp är att fosforyleringen påverkar spike-proteins interaktion med en receptor på ytan av värdcellerna.
Vilken aminosyra är mest lämplig att substituera amiosyra 578 med, om man vill härma fosforyleringen och studera dess roll?
Glutaminsyra
Serin
Tyrosin
Aspargin
Här tänkte jag att svaret skulle vara antingen serin eller tyrosin eftersom dessa kan fosforyleras, men svaret är glutaminsyra med motiveringen att det är negativt laddat. Jag förstår dock inte varför eftersom jag tolkar frågan som att man vill ha en annan aminosyra som kan fosforyleras. Jag förstår att fosfat är negativt laddat, men menar de då att de ska studera glutaminsyra istället för aminosyra 578?
Stod det verkligen härma, eller stod det möjligen hämma?
Du har rätt i att ser, tyr (samt thr) kan fosforyleras - men om du muterar aminosyraresten 578 till en av dessa aminosyror - vilken effekt förväntar du dig då på bindningen?
Och hur tror du mutantens inbindning kan skilja sig från den icke muterade 578?
Nu står det ju inte vilken aminosyra som sitter i position 578, men låt oss anta att det är serin, eftersom fosforylering av serin är den vanligaste fosforyleringen i proteiner.
Om du jämför serin och fosfoserin så ser du att skillnaden mellan dem är att man har satt på en fosfatgrupp som får en negativ laddning vid det pH som råder i cellerna.
Om du vill "härma" fosforyleringen så vill du byta ut serin mot en aminosyra som alltid innehåller en grupp som blir negativt laddad vid det pH som råder i cellerna. Kolla nu på glutaminsyra, och jämför den med serin och fosfoserin. Ser du att den innehåller en karboxylsyragrupp på den plats där fosfoserin har en fosfatgrupp?
Det är därför glutaminsyra har liknande egenskaper som fosfoserin, och därför kan man säga att man "härmar" fosforyleringen genom att byta ut serin mot fosfoserin.
Då förstår jag, tack för hjälpen!
