Aminosyror
Hur ska man veta laddningen på aminosyror vid olika PH värde ? Skulle ni rekommenderar en film på youtube ? Hittar inte en bra förklaring till det
Det beror på aminosyrans sidokedja, dess isoelektriska pH och lösningens pH.
Jag förstår inte riktigt vad menas med sidokedja? Samt kan du förklara hur gör man för att bestämma laddningen utan experiment ?
En aminosyra består alltid av en aminogrupp och en karboxylgrupp som bägge binder till en kolatom. Denna kolatom binder även till den s.k. sidokedjan som kan ha olika egenskaper (sur, basisk, polär, opolär osv). En aminosyra är totalt sett neutralt laddad i sin isoelektriska punkt (som är ett pH-värde). Om pH är högre än så blir aminosyran negativt laddad och om det är lägre blir den istället positivt laddad.
Tillägg: 15 nov 2022 19:34
Se @mag1:s kommentar nedan.
Isoelektriska punkt är att PH =7? Eller kan det variera
Det varierar, här har du några exempel:
Teraeagle skrev:Om pH är högre än så blir aminosyran negativt laddad och om det är lägre blir den istället positivt laddad.
Nej inte riktigt, vilken laddningen är vid pH värden över pI, beror på vilken typ sidokedja det är.
För en sur aminosyra kommer laddningen vara negativ, vid pH över aminosyrans pI (då karboxylsyran protolyserats).
Men är det istället en basisk aminosyra, kommer den vara oladdad vid pH över dess isoelektriska punkt (då aminogruppen protolyserats, d.v.s. den är i basformen).
Och motsvarande vid pH under pI, kommer sura aminosyror vara oladdade, och basiska vara laddade.
Hur ska jag kunna bestämma laddning om det är bara PH värde som anges i frågan utan PI?
Aminosyrornas respektive pI kan du antingen lista ut, genom att titta på den funktionella gruppen, och använda din kunskap ifrån Ke1 om t.ex. karboxylsyrors pKa.
Eller så kan du göra som man gör när andra detaljer inte är kända, t.ex. kolla i formelsamlingen/kemiboken/nätet.
Det finns en fråga på boken att man ska rita ett protein med två olika aminosyror och att ange vilken PH värde har man använt, samt vilken laddning har den pipted vid PH 8?
svaret är att vid PH 8 är N-terminal positiv och C-terminal negativ, sen beror nettoladning på vilka aminosyror man valt
Alltså jag förstår inte hur jag ska kunna besvara en sådan fråga?
Om du har en peptid, bildad av två aminosyror, kan de två aminosyrornas sidokedjor att påverka dipeptidens laddning.
Det enklaste är nog att försöka med din dipeptid. Välja två aminosyror (a,b) och slå upp deras pI värden, så får du reda på om och i så fall hur laddningen av a och/eller b är vid pH 8. Sedan behöver du bara summera samtliga laddningar, för att få fram laddningen på dipeptiden.
