Aminosyror
Hej!
jag förstår inte hur jag ska tänka när det kommer till d.)
a.) peptidbinding
b.) 4 stycken
c.) N-terminal = valin och C-terminal= alanin
d.) ?
Det har att göra med om de grupper som kan delta i syra/bas reaktioner (karboxylsyra- respektive aminogrupper) har tagit upp en extra proton, eller avgett en proton.
Titta på de grupper som kan ta upp/ge ifrån sig protoner, och jämför gruppernas pKa med pH. Karboxylsyror protolyseras generellt under pH 7, och aminogrupper tar gärna upp en proton vid pH 7. Båda dessa påverkar laddningen, t.ex. karboxylsyrans R-COOH => R-COO- + H+.
Och din peptids laddning är summan av alla negativa och positiva laddningar.
mag1 skrev:Det har att göra med om de grupper som kan delta i syra/bas reaktioner (karboxylsyra- respektive aminogrupper) har tagit upp en extra proton, eller avgett en proton.
Titta på de grupper som kan ta upp/ge ifrån sig protoner, och jämför gruppernas pKa med pH. Karboxylsyror protolyseras generellt under pH 7, och aminogrupper tar gärna upp en proton vid pH 7. Båda dessa påverkar laddningen, t.ex. karboxylsyrans R-COOH => R-COO- + H+.
Och din peptids laddning är summan av alla negativa och positiva laddningar.
Problemet är att provet endast ska handla om biokemi och vi har inte lärt oss att räkna med pKa. Hur ska jag göra?
pKa ingår väl i Ke1? Men oavsett kan du ta reda på vilka pKa värdena är för de funktionella grupperna, t.ex. på wikipediasidorna för respektive aminosyra. Och N- respektive C-terminalen kommer vid pH 7 båda vara laddade.
mag1 skrev:pKa ingår väl i Ke1? Men oavsett kan du ta reda på vilka pKa värdena är för de funktionella grupperna, t.ex. på wikipediasidorna för respektive aminosyra. Och N- respektive C-terminalen kommer vid pH 7 båda vara laddade.
Är nettoladdningen 0 då?
Ja precis. Vid pH 7 kommer N- och C-terminalens laddningar vara lika stora och motsatta, så de ger ingen laddning till molekylen.
Och dessa sidokedjorna saknar laddning (opolära och opolära, men påverka inte av pH).
