Aminosyror
Hej, jag behöver hjälp med en sak i en uppgift som jag inte förstår. Uppgiften lyder ''Använd dig av tabellen med aminosyrornas strukturformler på sidan 222-223 och skriv strukturformeln på följande dipeptider. Markera peptidbindningen i alla dina strukturformler. c) Pro-Ser''
När jag skrivit sekvensen för dessa två aminosyror upptäcker jag att kväveatomen i början bara binder till en väteatom, trots att den brukar binda till två för att räknas som en amingrupp. Ska jag anta att det inte finns någon amingrupp och därför ingen N-terminal? Eller räknas det ändå som en amingrupp och en N-terminal?
Bifogar en bild från vad det står i Facit (har skrivit exakt samma sak).
Det är fortfarande en aminoterminal i prolin, vilken du identifierade (högst upp till vänster i bilden). Det som är unikt för prolin är att den inte har en aminogrupp (-NH2), utan en sekundär amin istället (R-NH-R2). Aminoterminal anger att det finns en typ av amin i änden, men det behöver inte specifikt vara just bara en aminogrupp.
Aminogruppen (-NH2) kallas även primär amin.
Okej, det hade jag ingen aning om! Intressant! Tack!
Jag har en följdfråga om det är okej (handlar också om aminosyror). I läroboken jag har står det att en peptidbindning ser ut som bilden ovan, men kan jag anta att en peptidbindning kan se ut på olika sätt också? Känns som att jag bör kunna göra det, men frågar för säkerhetsskull! Bifogar en bild. 
När det inte är prolin binder N i amidbindningen till ett väte.
Ja den kan med prolin se ut som i d) också, det beror på i vilken ordning som aminosyrorna binder till varandra - jämför c) och d).
För aminosyror som inte är prolin binder kväveatomen i peptidbindningens (kallas även amidbindning, som Smaragdalena skrev) även till ett väte. Följande bild illustrerar hur peptidbindningen ser ut mellan de andra aminosyrorna:
Tack så hemskt mycket för svar både två! Nu förstår jag! :)
