Alternativt start site för transkription
Det humana genomet innehåller ca 21 000 proteinkodande gener men antalet uttryckta proteiner är mycket större. En forskargrupp som studerade detta fenomen introducerade ett alternativt start site för transkription i en gen och observerade då att det bildades två olika mRNA, varifrån två polypeptidkedjor av olika längd syntetiserades.
Vilken beskrivning stämmer bäst in på de bildade genprodukterna?
a) De resulterande mRNA-molekylerna har olika 3’-ändar
b) N-terminalen på de två resulterande proteinerna skiljde sig åt
c) Den kortaste mRNA-molekylen saknade cap
d) C-terminalen på de två resulterande proteinerna skiljde sig åt
Jag utesluter alternativ A för PolyA svans kommer finnas på 3' ände av bådar, c utesluts då cap krävs för att mRNA ska transporteras ut i cytosol. Rätt svar är B, men förstår ej varför inte D är rätt?
Vid translation byggs proteinet från C-terminalen, men starten är ändå AUG, dvs borde båda polypeptidkedjornas N-terminal vara metionin båda två, medan det i stället är C-terminalerna som förändras. Varför är detta fel? mvh
manne1907 skrev:Jag utesluter alternativ A för PolyA svans kommer finnas på 3' ände av bådar, c utesluts då cap krävs för att mRNA ska transporteras ut i cytosol. Rätt svar är B, men förstår ej varför inte D är rätt?
Vid translation byggs proteinet från C-terminalen,
Nej protein syntetiseras alltid med början i N-terminalen, ofta(st) med metionin som första aminosyrarest.
men starten är ändå AUG, dvs borde båda polypeptidkedjornas N-terminal vara metionin båda två, medan det i stället är C-terminalerna som förändras. Varför är detta fel? mvh
Ja starten är med AUG (oftast). Men det framgår i frågan att ett alternativt start site introducerades - och då vet du att förändringen är i början av den transkriberade mRNA sekvensen, och då hamnar "skillnaden" också i början av det translaterade proteinet.
Blev det klarare, varför alternativ d) är fel?
mag1 skrev:manne1907 skrev:Jag utesluter alternativ A för PolyA svans kommer finnas på 3' ände av bådar, c utesluts då cap krävs för att mRNA ska transporteras ut i cytosol. Rätt svar är B, men förstår ej varför inte D är rätt?
Vid translation byggs proteinet från C-terminalen,
Nej protein syntetiseras alltid med början i N-terminalen, ofta(st) med metionin som första aminosyrarest.
men starten är ändå AUG, dvs borde båda polypeptidkedjornas N-terminal vara metionin båda två, medan det i stället är C-terminalerna som förändras. Varför är detta fel? mvh
Ja starten är med AUG (oftast). Men det framgår i frågan att ett alternativt start site introducerades - och då vet du att förändringen är i början av den transkriberade mRNA sekvensen, och då hamnar "skillnaden" också i början av det translaterade proteinet.
Blev det klarare, varför alternativ d) är fel?
Yes menar att N-terminala aminosyran byggs först men sedan byggs väl peptidkedjan vidare på C-terminala kolet?
Tack för förklaringen, det låter rimligt 🙌🏼
manne1907 skrev:mag1 skrev:manne1907 skrev:Jag utesluter alternativ A för PolyA svans kommer finnas på 3' ände av bådar, c utesluts då cap krävs för att mRNA ska transporteras ut i cytosol. Rätt svar är B, men förstår ej varför inte D är rätt?
Vid translation byggs proteinet från C-terminalen,
Nej protein syntetiseras alltid med början i N-terminalen, ofta(st) med metionin som första aminosyrarest.
men starten är ändå AUG, dvs borde båda polypeptidkedjornas N-terminal vara metionin båda två, medan det i stället är C-terminalerna som förändras. Varför är detta fel? mvh
Ja starten är med AUG (oftast). Men det framgår i frågan att ett alternativt start site introducerades - och då vet du att förändringen är i början av den transkriberade mRNA sekvensen, och då hamnar "skillnaden" också i början av det translaterade proteinet.
Blev det klarare, varför alternativ d) är fel?
Yes menar att N-terminala aminosyran byggs först men sedan byggs väl peptidkedjan vidare på C-terminala kolet?
Då är jag med på hur du menade, men vid svar på en tenta(inlämningsuppgift skulle det tolkas som proteinets ände. När man beskriver N- och C-terminalen för ett protein, är sammanhanget proteinets/polypeptidkedjans ändar. Därför blir det felsyftande att skriva "från C-terminalen". Terminalerna är de som proteinet har när det är färdigsyntetiserat (och ev. modifierat). Riktningen i syntetiseringen är som du skrev från N- till C-terminalen.
Jämfört med t.ex. "polypeptidkedjan förlängs genom addition av ytterligare aminosyrarester till kedjans C-terminala ände", det beskriver vad som sker under syntesen och inte riktningen.
mag1 skrev:manne1907 skrev:mag1 skrev:manne1907 skrev:Jag utesluter alternativ A för PolyA svans kommer finnas på 3' ände av bådar, c utesluts då cap krävs för att mRNA ska transporteras ut i cytosol. Rätt svar är B, men förstår ej varför inte D är rätt?
Vid translation byggs proteinet från C-terminalen,
Nej protein syntetiseras alltid med början i N-terminalen, ofta(st) med metionin som första aminosyrarest.
men starten är ändå AUG, dvs borde båda polypeptidkedjornas N-terminal vara metionin båda två, medan det i stället är C-terminalerna som förändras. Varför är detta fel? mvh
Ja starten är med AUG (oftast). Men det framgår i frågan att ett alternativt start site introducerades - och då vet du att förändringen är i början av den transkriberade mRNA sekvensen, och då hamnar "skillnaden" också i början av det translaterade proteinet.
Blev det klarare, varför alternativ d) är fel?
Yes menar att N-terminala aminosyran byggs först men sedan byggs väl peptidkedjan vidare på C-terminala kolet?
Då är jag med på hur du menade, men vid svar på en tenta(inlämningsuppgift skulle det tolkas som proteinets ände. När man beskriver N- och C-terminalen för ett protein, är sammanhanget proteinets/polypeptidkedjans ändar. Därför blir det felsyftande att skriva "från C-terminalen". Terminalerna är de som proteinet har när det är färdigsyntetiserat (och ev. modifierat). Riktningen i syntetiseringen är som du skrev från N- till C-terminalen.
Jämfört med t.ex. "polypeptidkedjan förlängs genom addition av ytterligare aminosyrarester till kedjans C-terminala ände", det beskriver vad som sker under syntesen och inte riktningen.
Fint! Bara för att dubbelkolla om jag förstått det:
Låt sig att ett alternativt stopp site istället introduceras. Är det då som polypeptidkedjornas C-terminal hade skiljts åt?
Ja, längden på polypeptidkedjorna skulle skilja sig åt, samt sekvensen i den C-terminala änden.
mag1 skrev:Ja, längden på polypeptidkedjorna skulle skilja sig åt, samt sekvensen i den C-terminala änden.
Grymt, stort tack!!
För all del kul att det klarnade!
