5' och 3'
Varför måste de två olika strängarna ha olika 5' och 3'? Alltså, jag förstår varför den ena änden är 5' och den andra 3', eftersom fosfatgruppen endast kan fästa till 3'-änden, men jag förstår inte helt varför de två strängarna inte kan ha samma ände som 5'? Leading och lagging strand har ju tvärtom när det kommer till ändarna. Beror det på att det inte kan uppstå bindningar mellan strängarna annars? I så fall, varför?
Anledningen till att strängarna i DNA har olika direktionalitet (5' till 3') är flera. Det gör att den stabila antiparallella dubbelhelixen kan bildas (den är stabilare en motsvarande parallell dubbelhelix). Den antiparallella dubbelhelixen uppstår av en kombination av nukleotidernas basparande mellan strängarna, och av att strängarna gärna bildar en helikal struktur. Titta på dubbelhelixen så ser du att strängarna skapar en helix var, och tillsammans följer dessa helix varandra och bildar dubbelhelixen. Skulle strängarna gå åt samma håll, i en parallell dubbelhelix, skulle nukleotidernas basparande inte ske på samma vis.
Och fram för allt kan DNA-polymeraset arbeta på både leading och lagging strand samtidigt under replikationen. De vätebindningar som finns mellan nukleotidbaseran är ganska lätta att bryta så att DNA-polymeras kommer åt att binda in och syntetisera en ny komplementär sträng av DNA (röda i bilden nedan).
